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线性探针法用于分枝杆菌菌种快速鉴定的应用研究
文献摘要:
目的 探讨线性探针法用于分枝杆菌菌种快速鉴定的可行性和应用价值.方法 收集2017年1月至2018年12月深圳市慢性病防治中心、光明区人民医院和盐田区人民医院登记疑似结核病患者的分枝杆菌阳性培养物3420份.经GenoType MTBDRplus结核分枝杆菌耐药检测试剂盒初筛和剔除患者的重复样本后,筛选出127株非结核分枝杆菌(NTM)进行菌种鉴定.采用线性探针法和PCR基因测序法(16S rRNA和ITS)对NTM菌株进行菌种鉴定,并以测序结果为菌种鉴定的"金标准".结果 127株NTM的菌种分布为:脓肿分枝杆菌47株(37.0%),偶发分枝杆菌20株(15.8%),胞内分枝杆菌18株(14.2%),戈登分枝杆菌11株(8.7%),堪萨斯分枝杆菌8株(6.3%),鸟-胞内分枝杆菌复合群7株(5.5%),慢生黄分枝杆菌6株(4.7%),奇美拉分枝杆菌2株(1.6%),龟分枝杆菌1株(0.8%),蟾分枝杆菌1株(0.8%),瘰疬分枝杆菌1株(0.8%),外来分枝杆菌1株(0.8%),土分枝杆菌1株(0.8%),美容品分枝杆菌1株(0.8%),熊本分枝杆菌1株(0.8%)和富养二氧分枝杆菌1株(0.8%).与PCR相比,线性探针法对127株NTM全部检出,其中112株(112/127,88.2%)能准确鉴定到菌种,2株(2/127,1.6%)不能区分为瘰疬/胞内分枝杆菌,12株(12/127,9.4%)超出试剂盒鉴定范围,1株外来分枝杆(1/127,0.8%)鉴定错误.结论 线性探针法可以快速、准确地鉴定常见的分枝杆菌菌种,但菌种鉴定范围有限,不能完全满足临床菌种鉴定的需求.
文献关键词:
非结核分枝杆菌;线性探针法;基因测序;鉴定
中图分类号:
作者姓名:
朱玉梅;钟育权;李金莉;吴利凯;王峰
作者机构:
深圳市慢性病防治中心中心实验室,广东 深圳 518020
文献出处:
引用格式:
[1]朱玉梅;钟育权;李金莉;吴利凯;王峰-.线性探针法用于分枝杆菌菌种快速鉴定的应用研究)[J].新发传染病电子杂志,2022(02):47-51
A类:
线性探针法,GenoType,MTBDRplus
B类:
快速鉴定,慢性病防治,光明区,盐田区,结核病,耐药检测,检测试剂盒,初筛,非结核分枝杆菌,NTM,菌种鉴定,基因测序,16S,rRNA,ITS,金标准,菌种分布,脓肿分枝杆菌,偶发分枝杆菌,胞内分枝杆菌,戈登,堪萨斯分枝杆菌,合群,奇美,龟分枝杆菌,瘰疬,美容品,熊本,定常
AB值:
0.201193
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