典型文献
肌少症转录组数据挖掘及潜在生物标志物的鉴定
文献摘要：
目的 探讨与肌少症相关的潜在关键基因,为肌少症新的分子标记物及靶点提供依据.方法 从GEO数据库下载肌少症和健康对照组的转录组数据(GSE111017),用LIMMA软件包鉴定差异表达基因(DEGS).基于String数据库对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进行分析,并对DEGS进行功能富集分析.结果 共发现530个差异基因,其中上调基因419个,下调基因111个.这些基因主要富集在线粒体氧化应激、干细胞多能性信号通路调控、PPAR等信号通路上.结论 角蛋白1(KRT1)、过氧化物体增殖物激活受体γ辅激活因子1-α(PGC-1α)及LOR基因可能是肌少症的潜在生物标志物,线粒体氧化应激可能是肌少症发生、发展过程的主要原因.
文献关键词：
肌少症;差异表达基因;富集分析;线粒体
中图分类号：
作者姓名：
窦媛媛;李秋影;张晓阳
作者机构：
新疆医科大学第五附属医院老年病科,乌鲁木齐 830011
文献出处：
引用格式：
[1]窦媛媛;李秋影;张晓阳-.肌少症转录组数据挖掘及潜在生物标志物的鉴定)[J].国际老年医学杂志,2022(01):11-15
A类：
GSE111017
B类：
肌少症,转录组数据,潜在生物标志物,关键基因,分子标记物,GEO,下载,LIMMA,软件包,差异表达基因,DEGS,String,蛋白质相互作用,PPI,功能富集分析,差异基因,线粒体氧化应激,PPAR,角蛋白,KRT1,激活受体,PGC,LOR
AB值：
0.32231
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