典型文献
基于生物信息学和分子对接探讨"柴胡-黄芩"治疗IgA肾病机制的研究
文献摘要：
目的:利用生物信息学和分子对接技术探讨"柴胡-黄芩"药对干预IgA肾病差异表达基因的调控机制及物质基础.方法:筛选差异表达基因综合数据库GEO中IgA肾病基因样本,在中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP上筛选"柴胡-黄芩"药对的活性成分,将IgA肾病的差异基因和"柴胡-黄芩"药对的靶标蛋白取交集,用Cytoscape软件构建调控网络和蛋白相互作用网络,并进行拓扑结构分析及关键靶点筛选关键节点.利用PyMoL及AutoDock Vina软件对主要活性成分及高频靶标进行分子对接验证.用R i3863.6.2对交集基因进行GO富集分析和KEGG富集分析.结果:分析IgA肾病患者与正常人相比的差异基因,得到明显影响和改变的基因共347个,其中上调基因104个,主要富集在炎症反应中细胞纤维化、TNF信号通路和MAPK信号通路.从柴胡、黄芩中筛选槲皮素、山柰酚、黄芩素等38个活性成分,作用于JUN、MYC、CDKN1A等20个IgA肾病差异表达基因靶点,调节晚期糖基化终末产物及其受体(AGEs-RAGE)介导的信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等多种生物过程.结论:"柴胡-黄芩"的有效成分通过多个靶点、多条通路药干预IgA肾病差异基因表达.
文献关键词：
"柴胡-黄芩"药对;IgA肾病;GEO差异基因分析;网络药理学;调控机制;物质基础
中图分类号：
作者姓名：
贾蒙;毛逸鸣;衣轩葳;王怡
作者机构：
上海中医药大学 上海 201203;上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院肾内科 上海 200437
文献出处：
引用格式：
[1]贾蒙;毛逸鸣;衣轩葳;王怡-.基于生物信息学和分子对接探讨"柴胡-黄芩"治疗IgA肾病机制的研究)[J].中国中西医结合肾病杂志,2022(04):312-316,后插3-后插4
A类：
i3863
B类：
柴胡,IgA,利用生物,分子对接技术,技术探讨,药对,差异表达基因,调控机制,综合数据库,GEO,系统药理学,分析平台,TCMSP,靶标蛋白,交集,Cytoscape,软件构建,调控网络,蛋白相互作用网络,拓扑结构,关键靶点,靶点筛选,选关,关键节点,PyMoL,AutoDock,Vina,主要活性成分,富集分析,肾病患者,正常人,细胞纤维化,MAPK,槲皮素,山柰酚,黄芩素,JUN,MYC,CDKN1A,基因靶点,晚期糖基化终末产物,AGEs,RAGE,生物过程,有效成分,多条,差异基因表达,差异基因分析,网络药理学
AB值：
0.32513
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