典型文献
利用TCGA数据库研究ERGIC3在肺腺癌免疫微环境中的作用及其预后评价中的价值
文献摘要：
目的 通过数据挖掘分析ERGIC3在肺腺癌(LUAD)中的表达及其在肺腺癌微环境中的可能作用与临床意义.方法 通过TIMER和HPA等网站了解肺腺癌患者和正常人中ERGIC3表达量的差异,并使用UALCAN来揭示ERGIC3与临床特征的关系,应用Kaplan-meier探讨ERGIC3的预后价值,利用STRING分析与ERGIC3表达相关联蛋白质相互作用网络关系,并通过WebGestalt对上述基因进行功能富集分析,采用TIMER算法检测评估了ERGIC3表达与肺腺癌中免疫细胞浸润水平的相关性,最后借助TargetScan、starbase和miRDB预测可能与ERGIC3结合的microRNA.结果 ERGIC3在肺腺癌中表达显著增加,ERGIC3高表达的肺腺癌患者总生存期、首次进展生存期和进展后生存期均明显降低(P均<0.05).PPI网络分析发现ERGIC3与ERGIC2、SEC13和SEC63等10个蛋白存在紧密联系.与ERGIC3相互作用的基因主要富集在Lo-calization、Endomembrane system和Protein binding等细胞功能.ERGIC3在肺腺癌免疫微环境中,与多种肿瘤免疫细胞(CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞和树突状细胞)浸润呈负相关(P均<0.05).此外,hsa-miR-4731-5p可能通过靶向ERGIC3调控肺腺癌细胞增殖和迁移.结论 ERGIC3在肺腺癌中异常高表达,免疫调节在ERGIC3高表达肺腺癌的发生发展中起到重要作用,ERGIC3可能是与肺腺癌预后相关的潜在生物标志物.
文献关键词：
ERGIC3;肺腺癌;预后;免疫浸润;microRNA
中图分类号：
作者姓名：
刘梦媛;郑翔;许永杰;王进京;冯姗姗;张志敏;吴明松;李学英
作者机构：
遵义医科大学 医学遗传学教研室,贵州 遵义 563099;贵州省人民医院 检验科,贵州 贵阳 550002;遵义医科大学附属医院 病理科,贵州 遵义 563099;遵义医科大学 贵州省普通高等学校口腔疾病研究特色重点实验室暨遵义市口腔疾病研究重点实验室,贵州 遵义 563006
文献出处：
引用格式：
[1]刘梦媛;郑翔;许永杰;王进京;冯姗姗;张志敏;吴明松;李学英-.利用TCGA数据库研究ERGIC3在肺腺癌免疫微环境中的作用及其预后评价中的价值)[J].遵义医科大学学报,2022(04):450-456
A类：
ERGIC3,ERGIC2,SEC13,SEC63,Endomembrane
B类：
TCGA,数据库研究,免疫微环境,预后评价,挖掘分析,LUAD,TIMER,HPA,肺腺癌患者,正常人,UALCAN,Kaplan,meier,预后价值,STRING,相关联,蛋白质相互作用网络,网络关系,WebGestalt,功能富集分析,检测评估,免疫细胞浸润,TargetScan,starbase,miRDB,microRNA,总生存期,PPI,Lo,calization,system,Protein,binding,细胞功能,肿瘤免疫,CD8+T,CD4+T,巨噬细胞,嗜中性粒细胞,树突状细胞,hsa,5p,肺腺癌细胞,细胞增殖和迁移,免疫调节,潜在生物标志物,免疫浸润
AB值：
0.288287
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