典型文献
PARP1表达在预测结直肠癌总体生存中的作用
文献摘要：
目的 探讨PARP1的表达水平与结直肠癌预后的关系.方法 从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因图谱(TCGA)数据库下载PARP1基因的RNA-Seq数据,使用R软件绘制散点图并分析PARP1在结直肠癌和癌旁组织中的表达水平,将PARP1分为高、低表达组并进行生存分析、亚组生存分析和GSEA基因富集分析,筛选与PARP1相关的基因并进行GO、KEGG富集分析,鉴定与PARP1共表达的基因.结果 在GSE184093、GSE100179、GSE44076、GSE110225和TCGA数据集中,PARP1在肿瘤样本中的mRNA表达显著高于其在非肿瘤样本中的表达(P<0.05);以6.93作为阈值,分为PARP1高、低表达组,PARP1高表达组患者的总体生存期(OS)、无病生存期(DFS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展生存期(PFS)较PARP1低表达组显著缩短(P<0.05).在结直肠癌和癌旁组织中共筛出差异表达基因2629个,其中有765个基因与PARP1显著相关,GO分析显示PARP1相关基因与DNA聚合酶结合、组蛋白激酶活性、血小板衍生生长因子结合、卡哈尔体蛋白定位、端粒蛋白定位等有关;KEGG分析显示PARP1相关基因与DNA复制、细胞周期、错配修复等通路有关.结论 PARP1在结肠癌中表达上调,并与结直肠癌患者不良预后有关.
文献关键词：
结肠癌;PARP1;GEO;TCGA;预后
中图分类号：
作者姓名：
叶臻;林?
作者机构：
中山大学孙逸仙纪念医院消化内科,广州510120
文献出处：
引用格式：
[1]叶臻;林?-.PARP1表达在预测结直肠癌总体生存中的作用)[J].岭南现代临床外科,2022(05):466-474
A类：
GSE184093,GSE100179,GSE110225,卡哈尔
B类：
PARP1,基因表达综合数据库,GEO,癌症基因图谱,TCGA,下载,Seq,散点图,癌旁组织,低表达,生存分析,GSEA,基因富集分析,共表达,GSE44076,总体生存期,OS,无病生存期,DFS,疾病特异性生存期,DSS,无进展生存期,PFS,出差,差异表达基因,组蛋白,蛋白激酶,激酶活性,血小板衍生生长因子,蛋白定位,端粒,细胞周期,错配修复,结肠癌,结直肠癌患者,不良预后
AB值：
0.242447
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