典型文献
通过整合转录组与代谢组解析不同类型椰子的脂肪酸调控网络
文献摘要:
为了探究不同类型椰子中脂质种类和含量的差异,本研究利用非靶向代谢组学方法对海南高种和矮种椰子椰肉组织的代谢物进行了分析,共检测到12579种代谢信号,其中鉴定了564种代谢物,包括氨基酸、脂肪酸、类黄酮等.定量分析表明高种椰子的脂质总体含量高于矮种椰子,其中绿矮椰子脂质含量最低.甘油脂、鞘脂和脂肪酰是不同类型椰子中主要的差异物质.转录组数据结果表明,不同类型椰子中的差异基因主要参与脂肪酸代谢、α-亚麻酸代谢、木质素代谢和苯丙烷代谢.基于表达模式的不同将差异基因划分为20个不同的模块,其中"Melightyellow"模块与差异积累的脂肪酸高度相关.通过分析模块中脂质途径结构基因启动子区的cis-element,发现大多数脂质途径基因的启动子区存在多个MYB家族的结合位点及大量的激素信号响应元件.结果表明,MYB家族的转录因子可能在脂质的合成调控中发挥重要作用,并且激素可能作为一种信号分子参与到脂质的合成调控中.本研究通过组合策略对不同品种椰肉组织脂质差异的分子机理进行分析,并进一步构建了转录因子?结构基因?代谢物的合成调控网络,为后续解析脂质合成调控的分子机制提供了资源,为油脂椰子品种选育提供了依据.
文献关键词:
椰子;代谢组;转录组;WGCNA;脂质
中图分类号:
作者姓名:
邓渊;赖军;毛梦迪;张越冉;李淳;杨君;王守创;罗杰
作者机构:
海南大学 热带作物学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口 570228
文献出处:
引用格式:
[1]邓渊;赖军;毛梦迪;张越冉;李淳;杨君;王守创;罗杰-.通过整合转录组与代谢组解析不同类型椰子的脂肪酸调控网络)[J].热带生物学报,2022(05):478-487
A类:
椰肉,Melightyellow
B类:
椰子,调控网络,研究利用,非靶向代谢组学,代谢物,类黄酮,油脂,鞘脂,异物,转录组数据,数据结果,差异基因,脂肪酸代谢,亚麻酸,木质素代谢,苯丙烷代谢,表达模式,结构基因,基因启动子区,cis,element,MYB,结合位点,激素信号,响应元,合成调控,信号分子,组合策略,不同品种,分子机理,脂质合成,品种选育,WGCNA
AB值:
0.270473
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