典型文献
忍冬属黄酮合成酶基因FNSⅡ密码子偏好性及进化分析
文献摘要：
目的 探讨忍冬属木犀草苷关键合成酶基因FNSⅡ在进化过程中形成的密码子使用模式及其与不同植物的亲缘关系,为实现木犀草苷异源高表达提供依据.方法 利用Codon W、Clustal X、MEGA4.0及SPSS18.0软件,对23个不同物种的FNSⅡ基因及29条忍冬属FNSⅡ序列进行密码子偏好性和进化分析.结果 植物FNSⅡ的平均有效密码子数(ENC)为52.29,表明该基因密码子偏好性较弱;ENC-Plot分析发现FNSⅡ基因密码子偏好性形成主要受突变压力的影响,但忍冬属FNSⅡ更多受到自然选择压力的影响.忍冬属FNSⅡ序列GC含量均值<50％,GC3s均值在50％左右,ENC均值为52.66,整体密码子偏好性较弱.基于FNSⅡ序列的系统进化聚类分析较相对同义密码子使用度(RSCU)聚类分析更符合传统的物种分类结果.酵母是忍冬FNSⅡ最佳外源表达系统,模式植物拟南芥、烟草均可作为忍冬FNSⅡ的遗传转化受体.结论 忍冬属FNSⅡ序列表现出相似的密码子偏好性,可为忍冬属植物FNSⅡ基因的分类、演化与表达及植物育种研究提供依据.
文献关键词：
忍冬属;黄酮合成酶基因;FNSⅡ;密码子偏好性;进化分析
中图分类号：
作者姓名：
何志敏;曾子豪;朱肖霞;余清婷;胡珊巍;满威;刘素纯
作者机构：
长沙学院生物与环境工程学院,湖南 长沙 410003;湖南农业大学食品科技学院,湖南 长沙 410128
文献出处：
引用格式：
[1]何志敏;曾子豪;朱肖霞;余清婷;胡珊巍;满威;刘素纯-.忍冬属黄酮合成酶基因FNSⅡ密码子偏好性及进化分析)[J].中国中医药信息杂志,2022(05):105-111
A类：
黄酮合成酶基因,MEGA4
B类：
忍冬属,FNS,密码子偏好性,进化分析,木犀草苷,键合,使用模式,不同植物,亲缘关系,异源,Codon,Clustal,SPSS18,有效密码子数,ENC,Plot,突变压力,自然选择,选择压力,GC3s,系统进化,进化聚类,相对同义密码子使用度,RSCU,物种分类,酵母,外源表达,表达系统,拟南芥,烟草,遗传转化,序列表,植物育种,育种研究
AB值：
0.22674
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
