典型文献
细胞光老化模型的构建及多组学关联分析
文献摘要：
目的 构建血清饥饿预处理的人永生化角质形成细胞(HaCaT)光老化模型.通过多组学关联分析,探索中波紫外线(UVB)照射对HaCaT细胞光老化过程的生物学影响.方法 血清饥饿法预处理HaCaT细胞24 h,对HaCaT细胞进行20 mJ/cm2UVB照射.利用流式细胞术检测凋亡、高内涵细胞成像检测谷胱甘肽及线粒体跨膜电位、划痕实验检测细胞运动能力,判断光老化模型是否构建成功.对光照前后的HaCaT细胞进行高通量测序,分析miRNA及mRNA转录组中表达差异基因,挑选部分基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证,对差异基因进行通路富集.结果 UVB照射后细胞凋亡增加、谷胱甘肽水平降低、线粒体跨膜电位降低、运动迁移能力减弱,表明无血清条件下光老化建模成功.miRNA组学与mRNA组学关联分析,共得到106个交集差异基因.挑选其中4个关键基因:Ras激酶抑制因子1(KSR1)、胞质分裂作用因子1(DOCK1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肌球蛋白轻链激酶(MYLK)进行qRT-PCR验证,UVB照射前后的变化趋势与转录组趋势一致.对106个基因进行KEGG功能富集,其显著富集于p53及黏着斑信号通路.结论 血清饥饿预处理后,20 mJ/cm2UVB照射能成功构建HaCaT细胞光老化模型,p53及黏着斑信号通路是参与光老化过程的关键通路.
文献关键词：
光老化模型;人永生化角质形成细胞;高通量测序;转录组;差异基因
中图分类号：
作者姓名：
邹小仓;于仁峰;邹大阳;王可慧;李琳昊;徐雅晴;秦日辉;贺晓明;刘威;郭金鹏
作者机构：
军事科学院军事医学研究院,北京 100850;解放军疾病预防控制中心,北京 100071
文献出处：
引用格式：
[1]邹小仓;于仁峰;邹大阳;王可慧;李琳昊;徐雅晴;秦日辉;贺晓明;刘威;郭金鹏-.细胞光老化模型的构建及多组学关联分析)[J].军事医学,2022(08):576-583
A类：
cm2UVB,KSR1,胞质分裂作用因子
B类：
光老化模型,多组学,饥饿,人永生化角质形成细胞,HaCaT,中波紫外线,老化过程,生物学影响,mJ,流式细胞术,高内涵,细胞成像,成像检测,谷胱甘肽,膜电位,划痕实验,实验检测,细胞运动,运动能力,miRNA,转录组,表达差异,差异基因,qRT,通路富集,平降,动迁,迁移能力,无血清,下光,交集,关键基因,Ras,酶抑制,抑制因子,DOCK1,血管内皮生长因子,VEGFA,肌球蛋白轻链激酶,MYLK,功能富集,p53,黏着斑
AB值：
0.239007
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