精原干细胞(spermatogonial stem cells,SSCs)是成年动物睾丸中的成体干细胞,具有自我更新与分化的能力.小鼠(Mus musculus)精原干细胞来源于胚胎期的原始生殖细胞(primodial germ cells,PGCs),小鼠出生前原始生殖细胞处于有丝分裂静止状态,出生后恢复增殖并由曲细精管中央迁移至管壁基质,建立稳定的精原干细胞克隆.成熟小鼠的精原干细胞周期性地启动精子发生以维持雄性动物长期稳定的生殖能力.精原干细胞在其建立和成熟后是否具有特征上的差异目前尚不清楚.本研究在前期建立的不同年龄小鼠精原干细胞(表达多能性基因Pou5f1编码的OCT4)转录组数据基础上,对小鼠新生期(出生后3天)、幼年期(出生后7天)和成熟期(2～3月龄)精原干细胞的基因表达差异进行了生物信息学分析,包括差异表达基因(differentially expression genes,DEGs)的筛选、DEGs编码的蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)的建立、功能聚类富集(Gene Ontology,GO)和通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG),以及使用基于GO、KEGG和HALLMARK的基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA).结果显示,OCT4阳性精原干细胞在小鼠新生期、幼年期和成熟期存在大量差异表达基因,所编码的蛋白主要生物学功能集中在生物合成和能量代谢、免疫反应、细胞连接和迁移以及细胞分化等方面.精原干细胞细胞膜成分的显著变化可能影响精原干细胞的超敏反应、细胞间相互作用以及对细胞外环境因子的应答反应.在能量代谢方式上,随着年龄的增加,OCT4阳性精原干细胞逐渐从线粒体氧化磷酸化作用转变为糖酵解作用,同时也显著减少了细胞内核糖体形成相关基因的转录.这些结果为进一步研究雄性生殖干细胞形成和成熟的调控机制提供了新的思路.

精原干细胞;OCT4;转录组;差异表达基因

郭彦;杨乐乐;戚华宇

中国科学技术大学,生命科学与医学部生命科学学院医药生物技术系,合肥 230026;中国科学院广州生物医药与健康研究院,细胞谱系与发育研究中心,广州 510530

遗传

[1]郭彦;杨乐乐;戚华宇-.小鼠雄性生殖干细胞转录组分析揭示成熟精原干细胞特征)[J].遗传,2022(07):591-608,中插1

primodial,Pou5f1,HALLMARK,氧化磷酸化作用

雄性生殖,生殖干细胞,转录组分析,精原干细胞,spermatogonial,stem,cells,SSCs,睾丸,成体干细胞,自我更新,Mus,musculus,胚胎期,原始生殖细胞,germ,PGCs,生前,有丝分裂,静止,出生后,曲细精,细精管,移至,管壁,细胞克隆,细胞周期,周期性地,精子发生,生殖能力,具有特征,多能性基因,OCT4,转录组数据,数据基础,新生期,幼年期,成熟期,月龄,基因表达差异,生物信息学分析,差异表达基因,differentially,expression,genes,DEGs,蛋白相互作用网络,protein,interaction,PPI,Ontology,通路分析,Kyoto,Encyclopedia,Genes,Genomes,基因集富集分析,set,enrichment,analysis,GSEA,生物学功能,功能集,生物合成,能量代谢,免疫反应,细胞连接,细胞分化,细胞膜,超敏反应,细胞间相互作用,外环境,环境因子,应答反应,代谢方,线粒体氧化磷酸化,糖酵解,解作,核糖体,调控机制

0.382668