典型文献
美沙拉秦干预下IBD小鼠结肠组织的转录组分析
文献摘要：
目的 应用转录组测序技术(RNA sequencing,RNA-seq)检测炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)小鼠结肠组织的基因表达变化,增进对美沙拉秦(5-aminosalicylic acid,5-ASA)治疗IBD的分子机制的理解.方法 用葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium,DSS)建立IBD小鼠模型.将15只C57BL/6小鼠随机均分为三组:对照组、DSS组和DSS+5-ASA组.每组随机选择3只小鼠取结肠组织进行测序,经两组间比较,鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及重要生物学信号通路.随后通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者和经美沙拉秦治疗后患者结肠组织活检的微阵列(microarray)数据,验证前面鉴定得到的子显著DEGs.结果 DSS+5-ASA组与DSS组比较中共得到2983个差异表达基因,上调基因604个,下调基因753个;DSS组与对照组比较,共得到1626个差异表达基因,其中上调基因820个,下调基因806个.GO(gene ontology)和KEGG富集分析结果显示,这些DEGs与免疫反应等信号通路有关.部分表达差异显著的基因如Rnase1和Cxcl10,在UC患者结肠组织中有相似的表达趋势.结论 经美沙拉秦治疗的IBD模型小鼠结肠组织的基因表达谱,与IBD患者对比进行验证,得到数个IBD治疗过程中可能涉及的基因和生物学通路,增加了美沙拉秦对IBD治疗作用机制的进一步理解.
文献关键词：
炎症性肠病;美沙拉秦;葡聚糖硫酸钠;转录组测序;差异表达基因
中图分类号：
作者姓名：
王怡如;周唯;蒋笑影;潘一滨;许言午;曹永清
作者机构：
上海中医药大学附属龙华医院肛肠科,上海 200032;上海中医药大学基础医学院生物化学教研室,上海 201203
文献出处：
引用格式：
[1]王怡如;周唯;蒋笑影;潘一滨;许言午;曹永清-.美沙拉秦干预下IBD小鼠结肠组织的转录组分析)[J].中国实验动物学报,2022(01):7-16
A类：
DSS+5,Rnase1
B类：
美沙拉秦,IBD,结肠组织,转录组分析,转录组测序技术,sequencing,炎症性肠病,inflammatory,bowel,disease,表达变化,aminosalicylic,acid,ASA,葡聚糖硫酸钠,dextran,sulfate,sodium,小鼠模型,C57BL,随机选择,差异表达基因,differentially,expressed,genes,DEGs,基因表达数据库,expression,omnibus,GEO,溃疡性结肠炎,ulcerative,colitis,UC,活检,微阵列,microarray,ontology,富集分析,免疫反应,表达差异,Cxcl10,模型小鼠,基因表达谱,数个,治疗过程,生物学通路,治疗作用
AB值：
0.300178
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