典型文献
基于竞争内源性RNA网络探讨槲皮素在肺腺癌中的作用靶点
文献摘要:
目的:利用从肺腺癌(LUAD)数据集中筛选的差异表达基因(DEGs)、差异表达lncRNA(DElncRNA)及其上游miRNA,构建LUAD的竞争内源性RNA(ceRNA)网络,探索槲皮素可能的作用靶点.方法:从基因表达综合数据库(GEO)及肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中检索并筛选LUAD基因及lncRNA表达数据集,对差异表达基因(DEGs)进行富集和功能注释.使用在线数据库预测miRNA及lncRNA,建立ceRNA调控网络,并通过网络药理学分析槲皮素的药物靶点.结果:构建了AURKA与上游hsa-miR-363-3p及AP000553.1、LINC00858、AL354707.1的ceRNA调控网络,槲皮素与5DOS对接良好.结论:AP000553.1、LINC00858、AL354707.1与hsa-miR-363-3p竞争性调控AURKA,进一步影响LUAD预后,槲皮素可作用于AURKA.
文献关键词:
肺腺癌;TCGA;ceRNA网络;槲皮素
中图分类号:
作者姓名:
李经蕾;侯炜
作者机构:
中国中医科学院广安门医院,北京 100053;北京中医药大学,北京 100029
文献出处:
引用格式:
[1]李经蕾;侯炜-.基于竞争内源性RNA网络探讨槲皮素在肺腺癌中的作用靶点)[J].现代肿瘤医学,2022(02):197-201
A类:
AP000553,LINC00858,AL354707,5DOS
B类:
内源性,槲皮素,肺腺癌,作用靶点,LUAD,差异表达基因,DEGs,DElncRNA,miRNA,ceRNA,基因表达综合数据库,GEO,肿瘤基因组图谱数据库,TCGA,功能注释,调控网络,网络药理学,药理学分析,药物靶点,AURKA,hsa,3p,竞争性
AB值:
0.247911
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