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差异甲基化区域与肺腺癌发生发展的关系
文献摘要：
[目的]探讨差异化甲基区域与肺腺癌发生发展的关系.[方法]收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1-12月肺腺癌患者及健康对照组外周血各4例,采用Illumina高通量测序平台和850K芯片甲基化检测平台分别检测8例外周血基因谱数据,并以P＜0.05为标准筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及差异甲基化区域,进一步行DNA甲基化-基因表达联合分析得到目的基因.[结果]筛选出1 111个有意义的DEGs;针对DEGs各个区段甲基化的情况,筛选出4 519个差异甲基化基因,对比各组DNA甲基化和组间差异表达的全部基因,筛选出显著性差异表达基因和差异甲基化的基因,筛选得到6个目的基因,即CCR7、CD27、DSC1、LEF1-AS1、SLC8A1和LRRN3.GO功能分析显示差异甲基化区域在生物学途径、细胞成分和分子功能等方面密切相关.在GO功能和KEGG通路中,肺癌发生可能涉及CCL19和CCL21信号通路、缝隙连接、桥粒等分子机制,以及参与cGMP·PKG信号通路及钙离子信号通路等相关通路.[结论]CCR7、CD27、DSC1等甲基化的状态以及NFKB1-CCR7、STAT3-DSC1、SP1-CCR7等转录因子-基因表达调控网络可能参与肺癌的发生发展;差异甲基化区域在JNK通路及钙离子等信号通路中发挥着重要作用.
文献关键词：
肺腺癌;DNA甲基化;基因表达;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
李晓晗;曹国磊;牛海文;何丽丽;曹嘉芮;罗琴
作者机构：
新疆医科大学第三临床医学院,新疆 乌鲁木齐830011;新疆医科大学附属肿瘤医院,新疆 乌鲁木齐830011
文献出处：
引用格式：
[1]李晓晗;曹国磊;牛海文;何丽丽;曹嘉芮;罗琴-.差异甲基化区域与肺腺癌发生发展的关系)[J].肿瘤学杂志,2022(07):574-578
A类：
LRRN3
B类：
基区,新疆医科大学,肿瘤医院,肺腺癌患者,Illumina,高通量测序平台,850K,片甲,检测平台,谱数据,差异表达基因,differentially,expressed,genes,DEGs,联合分析,目的基因,区段,差异甲基化基因,选得,CCR7,CD27,DSC1,LEF1,AS1,SLC8A1,功能分析,生物学途径,细胞成分,CCL19,CCL21,缝隙连接,桥粒,cGMP,PKG,钙离子信号通路,相关通路,NFKB1,STAT3,SP1,基因表达调控,调控网络,JNK
AB值：
0.366222
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