典型文献
基于TCGA数据库筛选肺腺癌顺铂耐药的分子标志物及功能验证
文献摘要：
目的 探究在肺腺癌顺铂耐药过程中起关键调控作用的相关基因.方法 利用生物信息学方法在TCGA数据库和GDSC数据库下载肺腺癌患者顺铂敏感组与耐药组之间的差异表达基因,对差异基因进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,构建蛋白质互作网络,并进行层次聚类分析,筛选得到关键基因并利用实时荧光定量PCR和ELISA法在细胞水平进行验证.通过siRNA沉默A549/DDP细胞中CXCL10基因的表达并检测其对顺铂的敏感度.结果 筛选得到178个差异表达基因,经过聚类分析最终获得肺腺癌顺铂耐药的关键基因CXCL9、CXCL10、NKX2-1以及SFTPA1.暂时选择CXCL10进行后续验证及功能实验.实时荧光定量PCR结果显示CXCL10在A549/DDP细胞中的mRNA表达量显著高于A549细胞(P<0.001),A549/DDP细胞上清液中CXCL10蛋白的表达量高于A549细胞,均与生物信息学预测一致.MTT结果显示沉默CXCL10表达后,A549/DDP细胞对DDP的敏感度增加.结论 CXCL10是调控肺腺癌顺铂耐药的关键基因,下调CXCL10表达可成为逆转肺腺癌顺铂耐药的潜在靶点.
文献关键词：
肺腺癌;生物信息学;差异表达基因;顺铂耐药
中图分类号：
作者姓名：
王霖;黄紫弦;尤程程;谭顺梓;黄利鸣;黄益玲
作者机构：
443002 宜昌,肿瘤微环境与免疫治疗湖北省重点实验室;443002 宜昌,三峡大学医学院病理学系;445000 恩施,恩施市中心医院妇科
文献出处：
引用格式：
[1]王霖;黄紫弦;尤程程;谭顺梓;黄利鸣;黄益玲-.基于TCGA数据库筛选肺腺癌顺铂耐药的分子标志物及功能验证)[J].肿瘤防治研究,2022(06):569-574
A类：
SFTPA1
B类：
TCGA,顺铂耐药,分子标志物,功能验证,利用生物,生物信息学方法,GDSC,下载,肺腺癌患者,铂敏感,药组,差异表达基因,差异基因,功能分析,通路富集分析,蛋白质互作网络,层次聚类分析,选得,关键基因,siRNA,A549,DDP,CXCL10,CXCL9,NKX2,暂时,功能实验,上清液,MTT,潜在靶点
AB值：
0.225172
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