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高通量测序技术在细菌耐药中的应用
文献摘要：
细菌耐药已成为威胁全球人类公共健康的重要因素之一,快速、准确明确细菌耐药的特性、机制及传播特征对疾病治疗及控制耐药菌的传播具有重要意义.高通量测序技术可以同时平行检测多个基因序列的状态,已广泛应用于细菌耐药检测.目前高通量测序技术在细菌耐药领域的应用主要有:全基因组测序技术、目标区域测序技术和宏基因组测序技术.所采用的测序平台主要为Illumina、Ion Torrent、BGI 等二代测序和 Pacific Biosciences、Oxford Nonopore 等三代测序平台.通过细菌耐药基因预测细菌耐药表型的准确性在很大程度上依赖于成熟的专业耐药基因数据库,各种通用型、特异型及隐马尔可夫模型耐药基因数据库的建立和完善,为高通量测序技术在细菌耐药领域的应用提供了坚实的基础.本文简要介绍了高通量测序技术、数据分析方法及相应测序平台在细菌耐药领域中的应用进展,并同时介绍了细菌耐药数据库的现状.
文献关键词：
高通量测序技术;测序平台;细菌耐药;耐药基因;耐药基因数据库
中图分类号：
作者姓名：
陈慧娟;刘琪琦
作者机构：
北京工业大学环境与生命学部生命科学与化学学院生物医学工程系,北京100124;军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所,北京100850
文献出处：
引用格式：
[1]陈慧娟;刘琪琦-.高通量测序技术在细菌耐药中的应用)[J].中国生物化学与分子生物学报,2022(07):865-874
A类：
Nonopore,耐药基因数据库
B类：
高通量测序技术,细菌耐药,公共健康,传播特征,疾病治疗,耐药菌,基因序列,耐药检测,全基因组测序,目标区域,宏基因组测序技术,测序平台,Illumina,Ion,Torrent,BGI,二代测序,Pacific,Biosciences,Oxford,三代测序,过细,耐药表型,通用型,异型,隐马尔可夫模型,建立和完善,数据分析方法,并同
AB值：
0.231265
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