典型文献
原发性骨质疏松症相关核心基因的生物信息学分析
文献摘要：
目的 分析与原发性骨质疏松症(osteoporosis,OP)发病相关的差异表达基因,筛选OP治疗潜在药物靶点.方法 从公共基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)下载OP相关芯片数据,利用R软件对数据进行标准化处理后,筛选差异基因,对差异基因进行GO功能和KEGG通路富集分析、蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析和核心基因的筛选.结果 共筛选出差异基因569个,其中下调基因562个,上调基因7个.同时差异基因GO分析,主要富集为前体mRNA内含子结合、核体、组蛋白修饰、mRNA 3'端加工和调控结合等,而KEGG分析主要涉及的是泛素介导蛋白水解信号通路(hsa04120).PPI网络分析共有517个节点和363条连线.Cytoscape软件根据PPI分析数据筛选出了TCEB1、CUL2、KBTBD6、KBTBD7、ASB8、KLHL42、ASB5、FBXO11、ANAPC10、CDC23这10个核心基因,这些核心基因在OP患者股骨头组织的间充质干细胞中全部表达下调.结论 筛选出的差异基因和相关信号通路有助于理解OP发病的分子机制,同时为临床药物治疗OP的研究提供新思路.
文献关键词：
原发性骨质疏松症;生物信息学;蛋白互作网络;核心基因
中图分类号：
作者姓名：
杨洋;薛建华;虞俊波;顾琪琪;张亚峰;刘佳佳
作者机构：
南通大学附属医院创伤中心,江苏 南通226001;南通大学附属医院骨科,江苏 南通226001
文献出处：
引用格式：
[1]杨洋;薛建华;虞俊波;顾琪琪;张亚峰;刘佳佳-.原发性骨质疏松症相关核心基因的生物信息学分析)[J].中国骨质疏松杂志,2022(03):397-402
A类：
hsa04120,TCEB1,KBTBD6,ASB8,KLHL42,ASB5,ANAPC10,CDC23
B类：
原发性骨质疏松症,核心基因,生物信息学分析,osteoporosis,OP,差异表达基因,潜在药物,药物靶点,基因表达数据库,gene,expression,omnibus,GEO,下载,标准化处理,差异基因,通路富集分析,蛋白相互作用网络,protein,interaction,PPI,出差,时差,集为,内含子,核体,组蛋白修饰,调控结合,泛素,蛋白水解,连线,Cytoscape,数据筛选,CUL2,KBTBD7,FBXO11,股骨头,间充质干细胞,临床药物治疗,蛋白互作网络
AB值：
0.292426
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