典型文献
稳定型冠状动脉疾病向急性心肌梗死进展的生物标志物鉴定
文献摘要:
目的:分析稳定性冠状动脉疾病(SCAD)向急性心肌梗死(AMI)进展的核心基因及作用途径.方法:GEO数据库下载2个独立数据集GSE71226和GSE66360."limma"包进行差异基因分析.采用"ggplot2"包对GSE71226和GSE66360数据集获取差异基因取交集,并定义SCAD向AMI进展的关键基因.采用Cytoscape软件插件MCODE 1.5.1鉴定蛋白质相互作用(PPI)网络中的核心基因.选取中国人民解放军海军安庆医院2019年1月至2020年3月住院的168例SCAD患者作为SCAD组,选择同期正常体检的健康志愿者24例作为对照组.对SCAD组进行随访,发生AMI则定义为AMI组.结果:GSE71226数据集中获得1 122个差异基因,GSE66360数据集中获得463个差异基因,取交集后共获得48个关键基因.GO分析主要富集于环磷酸腺苷反应、对应力刺激的响应及炎症反应等;KEGG分析主要富集于IL-17信号通路及PIDIL1信号通路等.GSEA分析结果显示,关键基因中呈正相关的前3位最丰富基因集为线粒体反应途径、反应途径及基于CRISPR与初级纤毛发育相关的基因;负相关的前3位最丰富基因集为中性粒细胞脱颗粒反应、人体补体系统及脊髓损伤.鉴定出前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、转录因子AP(JUN)、CXC基序趋化因子配体2(CXCL2)及基质金属蛋白酶9(MMP9)4个核心基因.SCAD组患者PTGS2、JUN、CXCL2、MMP9蛋白表达高于对照组(P<0.05),AMI组患者PTGS2、JUN、CXCL2、MMP9蛋白表达高于SC AD组(P<0.05).ROC 曲线分析结果显示,PTGS2、JUN、CXCL2及 MMP9 AUC 分别为0.747(0.704-0.867)、0.775(0.714~0.887)、0.773(0.708-0.874)、0.850(0.794-0.972).结论:PTGS2、JUN、CXCL2、MMP9 4个核心基因可能参与 SCAD进展为 AMI 的病理机制并可预测SCAD进展为AMI.
文献关键词:
稳定型冠状动脉疾病;急性心肌梗死;基因;功能
中图分类号:
作者姓名:
冷利华;裴宜斌;周函;晏晶晶;何小伍;朱高;黄文胜
作者机构:
中国人民解放军海军安庆医院心血管内科,安庆246003
文献出处:
引用格式:
[1]冷利华;裴宜斌;周函;晏晶晶;何小伍;朱高;黄文胜-.稳定型冠状动脉疾病向急性心肌梗死进展的生物标志物鉴定)[J].中国免疫学杂志,2022(20):2517-2522
A类:
稳定型冠状动脉疾病,GSE71226,GSE66360,PIDIL1
B类:
急性心肌梗死,生物标志物,稳定性冠状动脉疾病,SCAD,AMI,核心基因,作用途径,GEO,下载,独立数,limma,差异基因分析,ggplot2,交集,关键基因,Cytoscape,插件,MCODE,蛋白质相互作用,PPI,中国人民解放军海军,安庆,健康志愿者,共获,环磷酸腺苷,应力刺激,GSEA,集为,反应途径,CRISPR,初级纤毛,毛发,细胞脱颗粒,补体系统,脊髓损伤,前列腺素,PTGS2,AP,JUN,基序,趋化因子配体,CXCL2,基质金属蛋白酶,MMP9,病理机制
AB值:
0.244654
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