基于计算机辅助药物设计结合复杂网络分析的研究体系,分析敦煌大补脾汤防治胃癌的潜在作用机制,并通过功效分组探讨其组方规律的科学内涵.通过细胞实验研究大补脾汤冻干粉溶液对胃癌细胞增殖活性的影响;利用TCMSP、TCMID数据库收集大补脾汤化合物成分,Swiss Target Prediction预测化合物潜在作用靶标,DrugBank、GeneCards、TTD、DisGeNET收集胃癌的潜在作用靶标,通过STRING数据库分析潜在作用靶点的蛋白互作.DAVID数据库进行KEGG富集分析;根据功效特点将大补脾汤分为温中组(干姜)、益气组(人参、甘草、白术)、养阴组(麦冬、五味子)和降逆组(旋覆花)4个功效配伍组,利用Cytoscape分别构建"药味-潜在活性成分-关键靶点"网络,分析功效分组配伍规律的科学内涵;采用Schr?dinger软件进行核心成分和核心靶点的分子对接验证,并通过结合模式分析和结合自由能计算挖掘大补脾汤发挥防治胃癌作用的物质基础,通过分子动力学模拟从动力学角度分析核心成药性靶点与代表潜在化合物的相互结合模式.细胞实验证实大补脾汤冻干粉溶液能够下调AGS胃癌细胞线粒体膜电位,使细胞周期被阻滞在G0/G1期(P＜0.05),抑制其增殖(P＜0.05).大补脾汤所含4个功效组富集的通路主要分布于机体能量代谢、炎症-免疫系统调节和周期-凋亡功能3个模块,各模块间通过共有靶标基因联结又各有侧重.分子对接结果显示,化合物甘草素、槲皮素、山柰酚、异鼠李素、麦冬高异黄酮A等可能是大补脾汤起效的多靶点成分;雌激素受体1、雄激素受体、ATP结合盒转运蛋白亚家族G2、表皮生长因子受体、糖原合酶激酶3β等靶点与各个潜在活性化合物之间的亲和力较好,可能是大补脾汤防治胃癌的潜在作用靶点,其中山柰酚与成药性靶点EGFR有较好结合能力,具有较好的结合稳定性.本研究基于计算机辅助药物设计结合复杂网络分析策略初步揭示了大补脾汤辅助防治胃癌的物质基础和分子机制,并探讨了大补脾汤不同功效组协同防治胃癌的科学内涵,为其临床应用提供化学生物信息学依据.

敦煌大补脾汤;胃癌;网络药理学;计算机辅助药物设计;分子机制;组方配伍规律

李程豪;张敏;林佳;张依茜;刘昊;王锐峰;和建政;李亚玲;靳晓杰;刘永琦

甘肃中医药大学,甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究重点实验室,甘肃兰州730000;甘肃中医药大学药学院,甘肃兰州730000;甘肃中医药大学,敦煌医学与转化教育部重点实验室,甘肃兰州730000

药学学报

[1]李程豪;张敏;林佳;张依茜;刘昊;王锐峰;和建政;李亚玲;靳晓杰;刘永琦-.敦煌医方大补脾汤对胃癌的体外活性及其配伍规律的计算机辅助药物设计分析)[J].药学学报,2022(07):2087-2100

敦煌大补脾汤

敦煌医方,体外活性,计算机辅助药物设计,设计分析,复杂网络分析,研究体系,潜在作用,组方规律,科学内涵,过细,细胞实验,冻干粉,胃癌细胞,细胞增殖活性,TCMSP,TCMID,化合物成分,Swiss,Target,Prediction,DrugBank,GeneCards,TTD,DisGeNET,STRING,数据库分析,作用靶点,蛋白互作,DAVID,富集分析,点将,干姜,益气,白术,养阴,麦冬,五味子,旋覆花,Cytoscape,药味,活性成分,关键靶点,组配,Schr,dinger,核心成分,核心靶点,分子对接,结合模式,模式分析,结合自由能,自由能计算,分子动力学模拟,成药性,相互结合,AGS,线粒体膜电位,细胞周期,G0,G1,所含,能量代谢,免疫系统,系统调节,模块间,靶标基因,甘草素,槲皮素,山柰酚,异鼠李素,异黄酮,起效,多靶点,雌激素受体,雄激素受体,ATP,转运蛋白,亚家族,G2,表皮生长因子受体,糖原,活性化合物,亲和力,EGFR,结合能,分析策略,协同防治,网络药理学,组方配伍规律

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