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典型文献
去势抵抗性前列腺癌潜在关键基因的生物信息学分析
文献摘要:
背景 去势抵抗性前列腺癌(CRPC)是男性常见恶性肿瘤疾病之一,病死率高,分子机制仍不十分清楚,且无有效治疗药物.目的 应用生物信息学方法挖掘CRPC发生、发展的关键基因,为其诊治提供新思路.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载关于人类原发性前列腺癌(PCa)和CRPC的数据集GSE32269并进行生物信息学分析.使用R语言鉴定CRPC的差异表达基因(DEGs).通过DAVID软件对DEGs进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析.利用STRING在线数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络进一步筛选关键基因,并对关键基因进行生存分析和受试者工作特征(ROC)曲线分析.结果 通过对微阵列数据集GSE32269分析共筛选出279个DEGs,进一步通过GO富集分析和KEGG通路分析发现在CRPC发展中,细胞分裂、有丝分裂和细胞周期等信号通路发挥重要作用.PPI网络分析筛选出15个关键基因,对关键基因进行生存分析发现:CDC20、MAD2L1和NUSAP1高表达组CRPC患者总生存率和无病生存率均分别低于CDC20、MAD2L1和NUSAP1低表达组(P<0.05);且CDC20、MAD2L1和NUSAP1预测CPRC发生的ROC曲线下面积分别为0.933、0.762、0.950,提示其对CRPC具有较高的诊断价值.结论 CDC20、MAD2L1和NUSAP1可能是参与CRPC发展的关键候选基因.
文献关键词:
前列腺癌;去势抵抗性前列腺癌;关键基因;生物信息学
作者姓名:
董婧婷;衡立;康绍叁;刘健;田志崇;张立国;张金存;李治国;沈宏;曹凤宏
作者机构:
063000 河北省唐山市,华北理工大学附属医院泌尿外科;063210 河北省唐山市,华北理工大学公共卫生学院;063000 河北省唐山市,华北理工大学现代教育中心
文献出处:
引用格式:
[1]董婧婷;衡立;康绍叁;刘健;田志崇;张立国;张金存;李治国;沈宏;曹凤宏-.去势抵抗性前列腺癌潜在关键基因的生物信息学分析)[J].中国全科医学,2022(08):937-944
A类:
GSE32269
B类:
去势抵抗性前列腺癌,关键基因,生物信息学分析,CRPC,恶性肿瘤疾病,病死率,分清,治疗药物,生物信息学方法,基因表达综合数据库,GEO,下载,PCa,差异表达基因,DEGs,DAVID,基因本体论,富集分析,京都基因和基因组百科全书,通路分析,STRING,数据库构建,蛋白质相互作用,PPI,选关,生存分析,受试者工作特征,微阵列数据,细胞分裂,有丝分裂,细胞周期,CDC20,MAD2L1,NUSAP1,总生存率,无病生存率,低表达,CPRC,诊断价值,候选基因
AB值:
0.235199
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