典型文献
玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析
文献摘要：
[目的]通过对玉蜀黍尾孢菌VelB基因进行生物信息学分析并构建敲除载体,为研究CzVelB调控玉蜀黍尾孢菌致病性的分子机制奠定基础.[方法]从JGI数据库中获得CzVelB基因序列,对其进行生物信息学分析,包括蛋白质的性质、保守区域、磷酸化位点、亚细胞定位、跨膜结构域和聚类分析,分析其基因功能.并采用同源互补原理构建CzVelB基因敲除载体,最终采用农杆菌介导遗传转化技术进行基因敲除.[结果]CzVelB基因编码385 AA,预测pI和MW分别为9.05和42.13645 kDa,是亲水性蛋白,无跨膜结构域.在亚细胞水平上,CzVelB定位在细胞核中.在氨基酸序列方面,具有多个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸激酶磷酸化位点;在功能上具有2个Velevt的保守结构域,并与As?pergillus flavus、A.niger亲缘关系较近,具有较高同源性.根据CzVelB基因序列设计特异性引物,扩增侧翼片段和标记基因,分别连入骨架载体pPZP100中,成功构建CzVelB基因的敲除载体,最终利用ATMT技术获得其敲除转化子.[结论]本文系统研究玉蜀黍尾孢菌VelB基因功能,并成功构建其敲除载体,获得敲除转化子,为后续研究CzVelB基因功能提供基础材料.
文献关键词：
玉蜀黍尾孢菌;VelB;生物信息学;敲除载体;敲除突变体
中图分类号：
作者姓名：
路媛媛;孙承龙;谭玉琴;魏文杰;史咸春;宋艳波;李丽;刘振宇
作者机构：
山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 园艺学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 信息科学与工程学院,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]路媛媛;孙承龙;谭玉琴;魏文杰;史咸春;宋艳波;李丽;刘振宇-.玉蜀黍尾孢菌VelB基因敲除及生物信息学分析)[J].山西农业大学学报（自然科学版）,2022(02):56-64
A类：
玉蜀黍尾孢菌,VelB,CzVelB,JGI,Velevt,pPZP100
B类：
基因敲除,生物信息学分析,敲除载体,致病性,基因序列,磷酸化,亚细胞定位,跨膜结构域,基因功能,互补原理,农杆菌介导,遗传转化,基因编码,AA,pI,MW,kDa,亲水性,细胞核,氨基酸序列,丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸激酶,保守结构域,pergillus,flavus,niger,亲缘关系,同源性,序列设计,特异性引物,侧翼,标记基因,连入,入骨,ATMT,技术获得,转化子,敲除突变体
AB值：
0.244938
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