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典型文献
基于COI基因序列的日本医蛭疑似种鉴定
文献摘要:
采用线粒体COI(细胞色素氧化酶Ⅰ亚基,tochrome oxidasesubunit Ⅰ)基因序列鉴别日本医蛭及其常见疑似种,并分析其遗传多样性和亲缘关系.以日本医蛭及其疑似种为材料,提取线粒体DNA,扩增其COI基因后进行测序,并计算遗传距离和聚类分析.结果显示,日本医蛭COI序列长度为680 bp,碱基A,T,C,G质量分数分别为35.1%,28.7%,16.2%和20.0%,碱基AT质量分数为63.8%;疑似种YS1~YS10的碱基A,T,C,G平均质量分数分别为39.8%,29.4%,15.2%和14.9%,碱基AT质量分数为69.2%.11种蛭类COI序列中有569个一致位点,84个变异位点,其中,40个位点发生了碱基转换,44个位点发生了碱基颠换,转换与颠换的比值为0.90.日本医蛭与疑似种的遗传距离在0.159~0.166之间.基于COI序列的DNA条形码技术可以很好地鉴定正品日本医蛭与其疑似种,本试验鉴定的疑似种均不是日本医蛭.
文献关键词:
日本医蛭;细胞色素氧化酶Ⅰ亚基;物种鉴定
作者姓名:
余米;苏胜齐;周梦;曹敏;封孝兰
作者机构:
重庆市药物种植研究所,重庆南川408435;西南大学水产学院,重庆400715;特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室,重庆南川408435
引用格式:
[1]余米;苏胜齐;周梦;曹敏;封孝兰-.基于COI基因序列的日本医蛭疑似种鉴定)[J].西南大学学报(自然科学版),2022(10):74-80
A类:
tochrome,oxidasesubunit,YS10
B类:
COI,基因序列,日本医蛭,细胞色素氧化酶,亚基,遗传多样性,和亲,亲缘关系,遗传距离,bp,碱基,AT,平均质量,变异位点,个位,条形码技术,正品,试验鉴定,物种鉴定
AB值:
0.220151
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