典型文献
短短芽孢杆菌TetR基因家族的鉴定及表达模式分析
文献摘要:
采用生物信息学方法从生防菌短短芽孢杆菌(Brevibacillus brevis)X23全基因组水平鉴定出13个TetR家族基因,将其命名为BbTetR1、…、BbTetR13,对其基本性质、基因结构和高级结构进行分析.结果表明:短短芽孢杆菌TetR家族成员在进化上具有保守性,基因序列长度为477~681 bp,编码的蛋白由168~226个氨基酸组成,相对分子质量为1.9×104~2.57×104,等电点为4.84~7.77;其基因家族成员可划分为3个亚族,亚族Ⅰ包含5个成员,亚族Ⅱ、亚族Ⅲ各包含4个成员;所有BbTetR蛋白均含有大量α–螺旋,且这些蛋白的空间结构呈现多样化;转录组分析结果表明,不同的BbTetR在短短芽孢杆菌不同生长时期的表达模式和表达量差异显著,BbTetR1、BbTetR5、BbTetR8和BbTetR10在短短芽孢杆菌不同生长阶段均有较高表达,推测其可能发挥更重要的调控作用.
文献关键词:
短短芽孢杆菌;TetR基因家族;生物信息学;表达模式
中图分类号:
作者姓名:
杜杰;雷平;张亮;龙青山;毕世宇;郭照辉;王运生;陈武;刘清术
作者机构:
湖南省微生物研究院,湖南 长沙 410009;湖南省农用微生物应用工程技术研究中心,湖南 长沙 410009;湖南农业大学植物保护学院,湖南 长沙 410128
文献出处:
引用格式:
[1]杜杰;雷平;张亮;龙青山;毕世宇;郭照辉;王运生;陈武;刘清术-.短短芽孢杆菌TetR基因家族的鉴定及表达模式分析)[J].湖南农业大学学报(自然科学版),2022(03):282-288
A类:
BbTetR1,BbTetR13,BbTetR,BbTetR5,BbTetR8,BbTetR10
B类:
短短芽孢杆菌,基因家族,表达模式分析,生物信息学方法,生防菌,Brevibacillus,brevis,X23,全基因组,家族基因,基本性质,基因结构,保守性,基因序列,bp,氨基酸组成,相对分子质量,等电点,转录组分析,生长时期,生长阶段
AB值:
0.220671
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