典型文献
动物脂肪细胞分化过程中全转录组3'-UTR动态变化研究
文献摘要：
基因转录调控,涉及3'-端非翻译区(3'-UTR)序列长度和组成动态调节,直接参与mRNA稳定性、亚细胞定位和翻译效率等生物学过程.研究表明,复杂性状(包括动物生产性能、人类疾病等)与3'-UTR密切相关.然而,动物前脂肪细胞分化过程中3'-UTR动态变化模式和规律鲜有报道.研究运用生物信息学方法,通过分析四种动物(鸡、鸭、猪和小鼠)不同分化时期前脂肪细胞转录组测序(RNA-seq)数据,检测并比较选择性多聚腺苷酸化动态变化.结果发现,京海黄鸡、北京鸭前脂肪细胞和小鼠3T3-L1细胞在分化过程中,存在3'-UTR长度动态变化,而长白猪中无变化.前脂肪细胞分化过程中,北京鸭和小鼠倾向于使用3'-UTR更短转录本;而京海黄鸡倾向于在分化前期和后期分别使用3'-UTR更长和更短转录本.基因功能富集分析发现,3'-UTR长度显著差异基因主要富集于脂肪细胞分化,脂质代谢,细胞生长和迁移等信号通路.综上,不同动物前脂肪细胞分化过程中,存在基因3'-UTR长度动态和规律变化,并同脂肪生成和脂类物质代谢相关,可为进一步研究脂肪生长发育分子调控机制提供新思路和参考.
文献关键词：
前脂肪细胞;转录组;3’-UTR;脂肪生成
中图分类号：
作者姓名：
杜志强;赵素娟;陈耀峰;丁然;殷宗俊;杨彩侠
作者机构：
东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030;长江大学动物科学学院,湖北 荆州 434025;安徽农业大学动物科学技术学院,合肥 230036
文献出处：
引用格式：
[1]杜志强;赵素娟;陈耀峰;丁然;殷宗俊;杨彩侠-.动物脂肪细胞分化过程中全转录组3'-UTR动态变化研究)[J].东北农业大学学报,2022(03):50-60
A类：
京海黄鸡
B类：
动物脂肪,脂肪细胞分化,UTR,变化研究,基因转录,转录调控,翻译区,动态调节,直接参与,亚细胞定位,翻译效率,生物学过程,复杂性状,动物生产,生产性能,人类疾病,前脂肪细胞,研究运用,生物信息学方法,分化时,转录组测序,seq,选择性多聚腺苷酸化,北京鸭,3T3,L1,长白猪,转录本,基因功能,功能富集分析,差异基因,脂质代谢,细胞生长,并同,脂肪生成,脂类物质,物质代谢,育分,分子调控机制
AB值：
0.297469
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