典型文献
基于TCGA数据库探索miR-4746-5p在肝癌中的表达及其临床意义
文献摘要：
目的 探讨miR-4746-5p在肝癌中的表达与临床意义.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取375例肝癌组织与50例癌旁组织RNA-seq数据及对应患者的临床信息,比较其miR-4746-5p表达水平与肝癌患者临床病理特征及预后的相关性;使用单、多因素Cox回归模型评估肝癌患者预后的危险因素;应用ROC曲线评估miR-4746-5p诊断肝癌的敏感性;利用ssGSEA评估miR-4746-5p表达水平与肝细胞癌(HCC)免疫浸润水平的相关性.结果 miR-4746-5p在肝癌组织中的表达显著高于正常肝组织及癌旁组织(P<0.01),并且miR-4746-5p表达水平与肝癌患者TMN分期、组织学水平、甲胎蛋白水平、是否伴血管侵犯及年龄密切相关(均P<0.05).高表达miR-4746-5p的肝癌患者总生存率与疾病特异性生存期明显低于miR-4746-5p低表达患者(均P<0.05).TNM分期与miR-4746-5p表达水平是相互独立的影响肝癌患者预后的危险因素(P<0.01).GO生物功能及KEGG富集分析提示,miR-4746-5p可能参与调节细胞分化、小GTP酶结合活性和轴突部组装等过程,其靶基因主要富集于MAPK信号通路、轴突引导信号通路、自噬信号通路;miR-4746-5p的表达水平与多种免疫细胞浸润水平(如巨噬细胞、Th2细胞、CD8 T细胞、NK细胞、中性粒细胞等)相关.此外,miR-4746-5p可能通过调控ASPG/CXCL12/IGF2/c11orf96/SEC31B轴促进HCC的发生发展并导致不良预后.结论 miR-4746-5p可作为诊断早期肝癌的标志物并对肝癌患者临床治疗及预后预测具有重要意义.
文献关键词：
肝癌;miR-4746-5p;癌症基因组图谱数据库;生物信息
中图分类号：
作者姓名：
程兆瑞;程小平;孙诚谊;喻超
作者机构：
贵州医科大学研究生院,贵阳 550000;南昌大学第一附属医院病理科,南昌 330006;贵州医科大学附属医院肝胆外科,贵阳 550000
文献出处：
引用格式：
[1]程兆瑞;程小平;孙诚谊;喻超-.基于TCGA数据库探索miR-4746-5p在肝癌中的表达及其临床意义)[J].南昌大学学报（医学版）,2022(02):49-55
A类：
ASPG,c11orf96,SEC31B
B类：
TCGA,miR,5p,肝癌组织,癌旁组织,seq,临床信息,肝癌患者,临床病理特征,Cox,模型评估,ssGSEA,肝细胞癌,HCC,免疫浸润水平,肝组织,TMN,甲胎蛋白,血管侵犯,总生存率,疾病特异性生存期,低表达,TNM,相互独立,生物功能,富集分析,细胞分化,GTP,结合活性,轴突,靶基因,MAPK,自噬,免疫细胞浸润,巨噬细胞,Th2,CD8,NK,CXCL12,IGF2,不良预后,早期肝癌,患者临床治疗,治疗及预后,预后预测,癌症基因组图谱数据库
AB值：
0.288546
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