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典型文献
基于网络药理学和分子对接技术探讨五味子治疗慢性咳嗽的机制研究
文献摘要:
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨五味子治疗慢性咳嗽的关键成分和潜在作用机制.方法 通过TCMSP数据库筛选五味子的活性成分及相应靶点,运用TTD、DisGeNET和DrugBank数据库收集咳嗽靶点集,再通过Venny平台筛选五味子活性成分和咳嗽的相关交集靶点.利用String网络平台和Cytoscape 3.8.2软件构建相关网络图及直方图,并得到关键靶点,通过Webgestalt网站对关键靶点进行KEGG和GO的富集分析.利用AutoDock Tools和Autodock Vina软件将关键靶点和核心成分进行分子对接,再通过Pymol软件进行可视化分析.结果 共筛选出8种有效活性成分和877个与活性成分相关的作用靶点;与咳嗽交集的相关靶点有88个,其中Akt1和Tnf为关键靶点.KEGG通路富集分析筛选得到27条通路,包括FcεRI信号通路、脂肪细胞因子信号通路、Toll样受体信号通路等;GO功能富集分析得到205个GO条目,主要涉及阴离子跨膜转运的负调控、细胞表面蛋白质定位的正向调节等生物过程,还涉及吞噬杯、囊泡等细胞组成,一氧化氮合酶调节活性、GTP酶激活蛋白结合等分子功能.分子对接结果显示核心成分戈米辛A和戈米辛R与关键靶点Akt1和Tnf有较好的结合活性.结论 初步揭示五味子发挥止咳作用的主要活性成分为戈米辛A和戈米辛R,其通过FcεRI和MAPK信号通路炎症介质调节发挥镇咳作用,关键靶点为Akt1和Tnf.
文献关键词:
五味子;咳嗽;网络药理学;分子对接;作用机制
作者姓名:
林豪;王阔;曾钦成;李贺;王春梅;陈建光;孙靖辉
作者机构:
北华大学药学院,吉林 吉林 132013
引用格式:
[1]林豪;王阔;曾钦成;李贺;王春梅;陈建光;孙靖辉-.基于网络药理学和分子对接技术探讨五味子治疗慢性咳嗽的机制研究)[J].北华大学学报(自然科学版),2022(04):466-470
A类:
B类:
网络药理学,分子对接技术,技术探讨,五味子,慢性咳嗽,关键成分,潜在作用,TCMSP,TTD,DisGeNET,DrugBank,点集,Venny,交集靶点,String,Cytoscape,软件构建,网络图,直方图,关键靶点,Webgestalt,AutoDock,Tools,Autodock,Vina,核心成分,Pymol,作用靶点,Akt1,Tnf,通路富集分析,选得,Fc,RI,脂肪细胞因子,Toll,样受体,功能富集分析,条目,阴离子,跨膜转运,负调控,细胞表面,表面蛋白,蛋白质定位,生物过程,吞噬,囊泡,细胞组成,一氧化氮合酶,GTP,激活蛋白,蛋白结合,结合活性,止咳,主要活性成分,MAPK,炎症介质,质调节,镇咳
AB值:
0.393549
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