典型文献
基于生物信息学筛选特发性肺纤维化差异基因及中药预测
文献摘要：
目的:采用生物信息学方法研究特发性肺纤维化(IPF)基因芯片数据,筛选差异表达基因,同时预测治疗特发性肺纤维化的潜在中药药物,探讨致病的潜在靶点及治疗药物.方法:从GEO数据库下载特发性肺纤维化数据并筛选差异表达基因(DEGs),利用STRING建立差异表达基因的蛋白互作网络并筛选关键基因(Hub genes),对关键基因进行GO功能注释与KEGG通路富集分析,最终通过Connectivity Map平台对关键基因筛选可能的治疗中药.结果:筛选出343个DEGs;PPI网络分析筛选出CCL2、SKIV2L2、SPP1、HSP90AA1、POLR2B等15个关键基因;GO分析表明,关键基因参与细胞外基质、细胞外基质的组织、胶原蛋白分解代谢的过程、细胞外基质结构成分等生物过程;KEGG通路分析显示,DEGs主要富集于糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、蛋白质消化吸收、IL-17信号通路、血小板激活、PI3K/Akt信号通路、细胞外基质受体相互作用等信号通路;并从CCL2、SKIV2L2、SPP1等12个关键基因筛选得到黄芪、三七、黄芩、丹参、党参等多味具有潜在疗效的中药.结论:本研究筛选了特发性肺纤维化的差异表达基因,明确了在IPF中关键基因及潜在的治疗性中药,为IPF临床治疗的新靶点及新药研发提供了新的方向.
文献关键词：
特发性肺纤维化;生物信息学;关键基因;中药预测
中图分类号：
作者姓名：
于晓涛;杨忠杰;应真真;裴瑗;张永威;王瑞
作者机构：
漯河市中心医院,河南 漯河 462000;河南省中药制剂与加工中医药重点实验室,河南 漯河 462000
文献出处：
引用格式：
[1]于晓涛;杨忠杰;应真真;裴瑗;张永威;王瑞-.基于生物信息学筛选特发性肺纤维化差异基因及中药预测)[J].中医药信息,2022(09):68-74,84
A类：
SKIV2L2,POLR2B
B类：
特发性肺纤维化,差异基因,中药预测,生物信息学方法,IPF,基因芯片,差异表达基因,潜在靶点,治疗药物,GEO,下载,DEGs,STRING,蛋白互作网络,选关,Hub,genes,功能注释,通路富集分析,Connectivity,Map,关键基因筛选,PPI,CCL2,SPP1,HSP90AA1,细胞外基质,胶原蛋白,分解代谢,基质结构,生物过程,通路分析,糖尿病并发症,RAGE,消化吸收,血小板激活,PI3K,Akt,选得,黄芪,三七,黄芩,丹参,党参,多味,治疗性,新靶点,新药研发
AB值：
0.291294
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