典型文献
基于网络药理学和分子对接法探索人参治疗再生障碍性贫血的分子机制
文献摘要：
目的 运用网络药理学与分子对接理论研究人参(Panax ginseng C.A.Meyer)治疗再生障碍性贫血(Aplastic anemia,AA)的分子作用机制,并通过体外实验进行验证.方法 通过TCMSP数据库筛选人参的主要活性成分及其靶点;采用Gene Cards数据库、GenCLiP3数据库、DisGeNET数据库以及OMIM数据库获取治疗AA有关靶点,利用venn图筛选人参治疗AA的潜在靶点;使用Cytoscape构建药物-活性成分-基因-疾病网络图,STRING数据库构建治疗靶基因的蛋白互作网络(Protein-Protein interaction network,PPI network)图;借助 ClusterProfiler 和 Pathview 对靶基因进行 GO(Gene Ontology)功能注释和 KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析以及可视化;通过SystemsDOCK对其进行分子对接.最后构建AA小鼠模型,分为空白对照组,模型组,人参二醇皂苷组和环孢霉素A组,给药2周后通过免疫印迹(Western blot)法检测相关蛋白含量及表达情况.结果 从人参中筛选出22种主要活性成分以及16个人参治疗 AA 的主要靶点,包括半胱氨酸蛋白水解酶3(Cysteine-containing aspartate-specific protease 3,CASP3)、半胱氨酸蛋白水解酶 1(Cysteine-containing aspartate-specific protease 1,C ASP 1)、B 淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,BCL-2)等靶点,GO及KEGG富集分析结果主要涉及相关信号通路凋亡、AGE-RAGE、TNF、NF-KB等;分子对接研究也表明调亡通路中的CASP3对应的晶体结构2h65和CASP 1对应的晶体结构1 ibc与人参二醇皂苷(Ginsenoside rh2)结合性紧密,结构稳定,结合力较强.Western blot实验结果表明,与模型组相比,Ginsenoside rh2显著上调CASP3和CASP1蛋白表达水平,具有统计学意义(P＜0.05).结论 通过网络药理学分析发现人参的Ginsenoside rh2可以调控CASP3、CASP1等靶点和凋亡等信号通路,分子对接中Ginsenoside rh2和CASP3、CASP1结合紧密,体外实验证实Ginsenoside rh2调控调亡通路的关键蛋白CASP3和CASP 1,从而发挥人参治疗AA的潜在疗效.
文献关键词：
网络药理学;分子对接;人参;再生障碍性贫血
中图分类号：
作者姓名：
于大海;吕浩;赵丽珠
作者机构：
哈尔滨商业大学 哈尔滨150076;中央与地方共建高等学校药学重点实验室 哈尔滨150076;黑龙江省预防与治疗老年病药物研究重点实验室 哈尔滨 150076
文献出处：
引用格式：
[1]于大海;吕浩;赵丽珠-.基于网络药理学和分子对接法探索人参治疗再生障碍性贫血的分子机制)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(02):749-761
A类：
GenCLiP3,Pathview,SystemsDOCK,2h65,ibc
B类：
分子对接法,再生障碍性贫血,网络药理学与分子对接,Panax,ginseng,Meyer,Aplastic,anemia,AA,分子作用机制,体外实验,TCMSP,选人,主要活性成分,Gene,Cards,DisGeNET,OMIM,venn,潜在靶点,Cytoscape,网络图,STRING,数据库构建,靶基因,蛋白互作网络,Protein,interaction,network,PPI,ClusterProfiler,对靶,Ontology,功能注释,Kyoto,encyclopedia,genes,genomes,通路分析,小鼠模型,空白对照,皂苷,免疫印迹,blot,蛋白含量,半胱氨酸蛋白,蛋白水解,水解酶,Cysteine,containing,aspartate,specific,protease,CASP3,cell,lymphoma,BCL,富集分析,RAGE,KB,对接研究,晶体结构,Ginsenoside,rh2,结合性,结构稳定,结合力,CASP1,蛋白表达水平,药理学分析,关键蛋白
AB值：
0.322432
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