典型文献
布氏轮藻肌动蛋白基因家族的全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
为了解肌动蛋白actin在轮藻植物生长发育中的潜在功能,本研究利用生物信息学方法对布氏轮藻肌动蛋白基因家族进行了鉴定及表达分析.在布氏轮藻中共鉴定出16个肌动蛋白基因,将其重命名为CbACT1～CbACT16,其氨基酸长度为361～1182 AA,相对分子质量为39 886.71～117 256.72 Da,等电点介于4.68～8.93;亚细胞定位预测显示15个肌动蛋白基因位于细胞质中,1个位于叶绿体中;二级结构结果表明肌动蛋白基因主要以无规则卷曲和a螺旋为主;共线性分析中仅发现一对源自片段重复的旁系同源基因;系统发育结果表明轮藻肌动蛋白基因可以分为两个亚家族,结合基因结构及保守基序分析,同一亚家族倾向于具有相似的外显子分布,较多的共有基序;基于启动子顺势作用元件分析表明,16个 肌动蛋白基因参与了许多与生物和非生物胁迫、激素调节和光反应有关的生命活动.组织表达分析显示,16个基因在四种不同组织中存在差异性表达,表明它们在不同组织的生长发育过程中具有不同的功能.因此,轮藻肌动蛋白基因家族可能参与了轮藻植物不同组织的发育过程及响应生物和非生物胁迫等的过程.
文献关键词：
布氏轮藻;肌动蛋白基因家族;系统进化分析;组织表达差异
中图分类号：
作者姓名：
胡莎莎;张冬群;张苡芃;韩鹏举;兰利琼;卿人韦
作者机构：
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610065
文献出处：
引用格式：
[1]胡莎莎;张冬群;张苡芃;韩鹏举;兰利琼;卿人韦-.布氏轮藻肌动蛋白基因家族的全基因组鉴定及表达分析)[J].四川大学学报（自然科学版）,2022(04):173-180
A类：
布氏轮藻,肌动蛋白基因家族,CbACT1,CbACT16,共有基序
B类：
全基因组鉴定,actin,植物生长发育,研究利用,利用生物,生物信息学方法,重命名,AA,相对分子质量,Da,等电点,亚细胞定位,定位预测,细胞质,个位,叶绿体,二级结构,无规则,卷曲,共线性分析,旁系,同源基因,系统发育,亚家族,基因结构,保守基序,外显子,启动子,顺势作用元件,非生物胁迫,激素调节,光反应,生命活动,组织表达分析,不同组织,差异性表达,系统进化分析,组织表达差异
AB值：
0.276193
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