典型文献
簸箕柳R2R3-MYB转录因子家族全基因组分析
文献摘要：
为研究簸箕柳中R2R3-MYB转录因子家族成员的分类和进化,以及在抗重力刺激中可能具有的功能,本研究使用全基因组鉴定策略和其它生物信息学手段对簸箕柳相关家族成员进行详细的分析.结果表明,在簸箕柳中共鉴定出158个R2R3-MYB蛋白,这些成员进一步被分为23个亚组.基因结构和基序组成分析表明,在同一亚组中的基因通常具有相似的内含子-外显子结构和相似的基序组成,进一步支持了系统发育分析的结果.通过共线性分析了SsMYB家族的进化,85对SsMYB基因被预测来自串联或者片段复制事件,这在SsMYB家族的扩展中起着重要作用.此外,本研究利用RNA-seq数据分析重力刺激下SsMYB基因的表达情况,筛选出20个潜在的MYB抗重力刺激蛋白.
文献关键词：
簸箕柳;R2R3-MYB;转录因子;全基因组分析
中图分类号：
作者姓名：
王岚春;沈方圆;欧阳丹;李校
作者机构：
四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064
文献出处：
引用格式：
[1]王岚春;沈方圆;欧阳丹;李校-.簸箕柳R2R3-MYB转录因子家族全基因组分析)[J].四川大学学报（自然科学版）,2022(03):147-156
A类：
簸箕柳,SsMYB
B类：
R2R3,全基因组分析,全基因组鉴定,鉴定策略,基因结构,基序,组成分析,内含子,外显子,系统发育分析,共线性分析,研究利用,seq
AB值：
0.1583
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