典型文献
m6A修饰的LncRNA对宫颈癌预后及免疫治疗反应评估的价值
文献摘要:
目的:研究N6-甲基腺嘌呤(m6A)相关的长链非编码RNA(m6A-LncRNA)对宫颈癌预后和免疫治疗反应评估的价值.方法:通过TCGA数据库下载304例宫颈癌病例的转录组数据及临床资料.选择25个m6A调节因子,通过Pearson相关分析和Cox回归鉴别宫颈癌预后相关m6A-LncRNA,再利用Cox回归建立基于m6A-Ln-cRNA的宫颈癌预后风险评分,风险评分=∑LncRNAi的回归系数×LncRNAi表达量.利用Cox回归建立基于风险评分的宫颈癌预后预测模型并绘制列线图.通过C指数、ROC曲线和校准曲线评估列线图的判别和校准能力.利用CIBERSORT反卷积算法分析22种肿瘤浸润免疫细胞丰度和免疫表观评分(IPS).结果:所构建的风险评分包括11个m6A-LncRNA(FAM198B-AS1、AC233728.1、AL021707.6、AC131159.1、DDX11-AS1、AC099850.4、DDN-AS1、U62317.4、LINC02802、AC015922.2、EP300-AS1).利用风险评分与临床分期构建了宫颈癌预后预测模型.在建模数据集(n=266)和验证集(n=181)中,该模型1、3和5 a生存预测的ROC曲线下面积均大于0.7(P<0.05),经Bootstrap方法内部验证(重复1000次)后的C指数分别为0.753和0.755,校正曲线显示预测结果与实际结果相关性良好.以风险评分的中位数作为界值,将304例宫颈癌病例分为高风险和低风险组,低风险组富含CD8+T细胞、调节T细胞和未活化的肥大细胞,IPS评分更高.结论:m6A-LncRNA具有潜在的宫颈癌预后预测和免疫治疗反应评估价值.
文献关键词:
N6-甲基腺嘌呤;长链非编码RNA;宫颈癌;预后评估;免疫治疗
中图分类号:
作者姓名:
郭依琳;林钰博;白洋洋;赵虎;王武亮
作者机构:
郑州大学第二附属医院妇产科 郑州 450014;桂林医学院临床医学系 广西桂林 541199;河南省中医院泌尿外科 郑州450002
文献出处:
引用格式:
[1]郭依琳;林钰博;白洋洋;赵虎;王武亮-.m6A修饰的LncRNA对宫颈癌预后及免疫治疗反应评估的价值)[J].郑州大学学报(医学版),2022(06):773-779
A类:
LncRNAi,FAM198B,AC233728,AL021707,AC131159,DDX11,U62317,LINC02802,AC015922
B类:
m6A,宫颈癌,免疫治疗,治疗反应,N6,腺嘌呤,长链非编码,TCGA,下载,癌病,转录组数据,调节因子,Cox,预后风险,风险评分,回归系数,基于风险,预后预测模型,列线图,校准曲线,准能,CIBERSORT,反卷积算法,算法分析,肿瘤浸润免疫细胞,IPS,分包,AS1,AC099850,DDN,EP300,利用风险,临床分期,建模数据,验证集,生存预测,Bootstrap,内部验证,校正曲线,中位数,低风险组,CD8+T,肥大细胞,评估价值,预后评估
AB值:
0.267972
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