典型文献
基于TCGA数据库构建雌激素受体阳性乳腺癌患者的预后风险模型
文献摘要：
目的:构建微小RNA(miRNA)表达的预测雌激素受体(ER)阳性乳腺癌患者预后的风险模型.方法:分析了TCGA数据库下载的ER阳性乳腺癌患者的miRNA表达数据和临床资料,筛选出与ER阳性乳腺癌特异性相关的miRNA并构建了miRNA-临床的预测ER阳性乳腺癌患者3年和5年生存率的预测模型.受试者工作曲线(ROC)和校准曲线用于评估列线图的预测能力和准确性.最后分析了miRNA在他莫昔芬治疗复发组与未复发组的表达情况.使用DAVID工具进行miRNA靶基因的GO功能富集和KEGG信号通路富集.结果:Lasso回归分析最终得到与预后相关的4个miRNA(miR-331、miR-615、miR-653、miR-887)并计算风险评分,风险评分可以有效地区分低风险患者和高风险患者.随后,我们构建了包含风险评分和临床特征的预后模型.曲线下面积(AUC)显示,该模型具有较好的预测能力和准确性(3年A UC=0.768,5年AUC=0.849).GSE37405数据集中miRNA表达分析显示miR-331在他莫昔芬治疗复发组的表达明显高于他莫昔芬治疗未复发组(P=0.018).GO功能富集分析和KEGG信号通路分析表明,miR-331的靶基因主要参与蛋白质结合、转录调控和mRNA监视途径.结论:我们构建了miRNA-临床的预后模型,该模型可有效预测ER阳性乳腺癌患者的3年和5年生存率,并有利于制定个体化治疗决策.
文献关键词：
雌激素受体阳性乳腺癌;miRNA;TCGA;列线图
中图分类号：
作者姓名：
杨燕;贺鑫;龚鹏举;宋文静;魏蕾;张京伟
作者机构：
武汉大学中南医院甲状腺乳腺外科 湖北武汉430071;武汉大学基础医学院病理与病理生理学教研室 湖北武汉430071
文献出处：
引用格式：
[1]杨燕;贺鑫;龚鹏举;宋文静;魏蕾;张京伟-.基于TCGA数据库构建雌激素受体阳性乳腺癌患者的预后风险模型)[J].武汉大学学报（医学版）,2022(02):243-249
A类：
GSE37405
B类：
TCGA,数据库构建,雌激素受体阳性乳腺癌,乳腺癌患者,预后风险模型,miRNA,ER,下载,受试者工作曲线,校准曲线,列线图,预测能力,他莫昔芬,DAVID,靶基因,信号通路富集,Lasso,计算风险,风险评分,低风险,高风险患者,预后模型,表达分析,功能富集分析,通路分析,蛋白质结合,转录调控,监视,个体化治疗,治疗决策
AB值：
0.191975
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