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典型文献
脓毒症心肌功能障碍关键基因的筛选及生物信息学分析
文献摘要:
目的 筛选脓毒症心肌功能障碍(SIMD)的关键基因,分析其主要参与的生物学过程.方法 利用R软件对脓毒症患者及SIMD小鼠模型的数据集进行差异分析,提取SIMD相关基因,并进行生物学分析、相关性分析及蛋白质-蛋白质相互作用网络分析.结果 脓毒症小鼠模型、脓毒症患者分别有143个和318个差异基因,其中包含84个SIMD基因,下调基因54个,上调基因30个.脓毒症及SIMD差异基因在基因本体和京都基因和基因组数据库富集分析中具有相似的生物学功能.ANXA3、S100A8、LCN2、LTF、KLHL2等为SIMD的关键基因;LTF、LCN2、SOCS3等为SIMD的关键蛋白.结论 LCN2、LTF、ANXA3、S100A8、KLHL2、SOCS3等多个关键基因可能参与SIMD的病理生理过程,对SIMD的临床诊断、预后判断及治疗有进一步研究意义.
文献关键词:
脓毒症;脓毒症心肌功能障碍;生物信息学分析;高通量基因表达数据库;关键基因
作者姓名:
蒋万威;杨国辉
作者机构:
贵州医科大学临床医学院,贵州贵阳 550004
文献出处:
引用格式:
[1]蒋万威;杨国辉-.脓毒症心肌功能障碍关键基因的筛选及生物信息学分析)[J].中国医药导报,2022(03):24-28,33
A类:
KLHL2
B类:
脓毒症心肌功能障碍,关键基因,生物信息学分析,SIMD,生物学过程,小鼠模型,生物学分析,蛋白质相互作用网络,脓毒症小鼠,差异基因,基因本体,京都,基因组数据,富集分析,生物学功能,ANXA3,S100A8,LCN2,LTF,SOCS3,关键蛋白,病理生理,生理过程,预后判断,研究意义,高通量基因表达数据库
AB值:
0.225949
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