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典型文献
梅花鹿MSRB3基因多态性及其与茸重性状的关联分析
文献摘要:
[目的]本研究旨在探索梅花鹿甲硫氨酸亚砜还原酶B3(methionine sulfoxide reductase B3,MSRB3)基因多态性及其与茸重性状的关联性.[方法]选取高、低产茸量的梅花鹿各8只,应用DNA直接测序法检测基因变异位点.采用MassARRAY? SNP分型技术对314头24月龄梅花鹿MSRB3基因进行基因分型,并结合梅花鹿茸重性状数据进行了关联分析和单倍型分析.[结果]在梅花鹿MSRB3基因中共发现6个SNPs位点,其中2个SNPs位点位于外显子区域,且突变均未引起氨基酸改变,属于同义突变,其余4个SNPs位点均存在于内含子区域.分型结果显示4个样本未分型成功,其余310个样本进行后续分析.各位点观测杂合度和期望杂合度基本一致,g.44455582 T>C、g.44455759 C>T、g.44414424 T>C、g.44350306 T>C 及 g.44340836 G>A 等 5 个位点的杂合度较高,均属于中度多态(0.25<PIC<0.5),g.44340734 G>C位点杂合度较低,属于低度多态(PIC<0.25).卡方检验结果表明,g.44455759 C>T位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),其他5个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).对6个SNPs位点的不同基因型与梅花鹿茸重的关联分析结果表明,g.44455582 T>C位点的TT基因型个体茸重极显著高于CC和TC基因型(P<0.01).单倍型分析结果显示,g.44340734 G>C 和g.44350306 T>C、g.44455582 T>C 和 g.44455759 C>T 位点存在强连锁,各产生 3 种单倍型,在Block 2区块中单倍型TC茸重显著高于单倍型CT(P<0.05).[结论]MSRB3基因与梅花鹿茸重性状密切相关,g.44455582 T>C位点和单倍型TC可作为筛选高产梅花鹿的分子标记.
文献关键词:
梅花鹿;MSRB3基因;SNPs;茸重
作者姓名:
周雅;张禾垟;刘琳玲;李浩东;郑军军;王桂武
作者机构:
中国农业科学院特产研究所,长春130112
文献出处:
引用格式:
[1]周雅;张禾垟;刘琳玲;李浩东;郑军军;王桂武-.梅花鹿MSRB3基因多态性及其与茸重性状的关联分析)[J].中国畜牧兽医,2022(11):4279-4287
A类:
B类:
MSRB3,基因多态性,茸重,甲硫氨酸亚砜,还原酶,methionine,sulfoxide,reductase,低产,直接测序,基因变异,变异位点,MassARRAY,月龄,基因分型,梅花鹿茸,单倍型分析,SNPs,外显子,同义突变,内含子区域,未分,各位,杂合度,个位,PIC,低度,卡方检验,Hardy,Weinberg,平衡状态,不同基因型,TT,CC,连锁,Block,分子标记
AB值:
0.240044
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