首站-论文投稿智能助手
典型文献
藏羊BMPR Ⅱ基因多态性及其单倍型与产羔性状相关分析
文献摘要:
[目的]研究骨形态发生蛋白受体Ⅱ(bone morphogenetic protein receptorⅡ,BM PRⅡ)基因多态性及其单倍型与藏羊产羔性状的相关性.[方法]以433只藏羊母羊为研究对象,采用改良多重高温连接酶检测反应技术(improved multiple ligase detection reaction,iMLDR)对BMPRⅡ基因9个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点在藏羊群体中的多态性进行检测,使用Haploview 4.2软件分析其连锁不平衡性并构建单倍型,应用基因关联分析探究BMPRⅡ基因多态性及单倍型与藏羊产羔性状的关联.[结果]藏羊BMPRⅡ基因外显子12中存在6个SNPs,分别为:g.90192 T>C、g.142532 C>T、g.142614 A>G、g.142751T>C、g.143138 A>G和g.143189 G>A,外显子3、9和13中各存在1个SNP,分别为:g.143570 C>G、g.124843 A>C和g.145233 A>G,这9个SNPs均为同义突变.9个SNPs中,除g.90192 T>C外,均存在3种基因型.多态信息含量分析显示,群体在g.90192 T>C、g.142614 A>G和g.145233 A>G位点处于低度多态(PIC<0.25),在g.124843 A>C、g.142532 C>T、g.142751T>C、g.143138 A>G、g.143189 G>A和g.143570 C>G位点均处于中度多态(0.25< PIC<0.5).x2适合性检验结果显示,所有突变位点均未偏离哈代-温伯格平衡状态.相关性分析显示,不同位点不同基因型与藏羊产羔性状均无显著相关(P>0.05),但g.142532 C>T位点CT基因型平均产羔数高于CC和TT基因型,g.142751T>C位点CC基因型平均产羔数高于TT和TC基因型,g.143189 G>A位点GA基因型平均产羔数高于GG和AA基因型,g.143570 C>G位点CG基因型平均产羔数高于CC和GG基因型,g.145233 A>G位点GG基因型平均产羔数高于AA和AG基因型,差异均不显著(P>0.05).BMPRⅡ基因中除g.90192 T>C位点外的8个SNPs位点在藏羊群体中共形成14种单倍型(H1~H14),单倍型与藏羊产羔数间均无显著相关(P>0.05).[结论]BMPRⅡ基因g.142532 C>T、g.142751T>C、g.143189 G>A、g.143570 C>G和g.145233 A>G位点对藏羊产羔数有一定潜在的影响.
文献关键词:
藏羊;BMPRⅡ基因;单核苷酸多态性;单倍型;产羔数
作者姓名:
李明明;吴庆伟;邓玉婷;靳生伟;贺娜;张军霞
作者机构:
青海大学农牧学院,西宁810016
文献出处:
引用格式:
[1]李明明;吴庆伟;邓玉婷;靳生伟;贺娜;张军霞-.藏羊BMPR Ⅱ基因多态性及其单倍型与产羔性状相关分析)[J].中国畜牧兽医,2022(02):587-597
A类:
142751T
B类:
藏羊,BMPR,基因多态性,单倍型,产羔性状,骨形态发生蛋白,bone,morphogenetic,protein,receptor,母羊,良多,连接酶检测反应,improved,multiple,ligase,detection,reaction,iMLDR,单核苷酸多态性,single,nucleotide,polymorphism,羊群,Haploview,连锁不平衡,不平衡性,分析探究,外显子,SNPs,同义突变,多态信息含量,含量分析,低度,PIC,x2,适合性检验,突变位点,哈代,温伯格,平衡状态,不同基因型,产羔数,CC,TT,GA,GG,AA,CG,AG,共形,H14,数间
AB值:
0.274717
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。