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地被菊bHLH转录因子基因家族鉴定及其低温胁迫响应
文献摘要：
地被菊(Chrysanthemum morifolium)是菊科菊属多年生宿根草本植物,花型整齐,色彩多样,有较高的观赏价值.北方地区温度低,严重限制了地被菊的栽培范围.碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族广泛参与植物的生长发育和非生物胁迫响应.本研究以地被菊'映洁'为材料,根据转录组数据克隆了 17个CmbHLHs基因,ORF在603～1 242 bp之间,对蛋白理化性质进行预测分析发现,17个CmbHLHs蛋白中8个蛋白为酸性,9个蛋白为碱性,这些蛋白都定位在细胞核上.bHLH蛋白二级结构α-螺旋占比为25.49％～51.50％,β-转角占比为1.42％～5.88％;miRNA预测分析显示,9个miRNA可能调控8个CmbHLHs基因转录后的表达.利用MEME软件预测CmbHLH基序组成,共鉴定出6个保守基序,除CmbHLH8和CmbHLH15外,其他蛋白都包含基序1和基序2.系统发育分析显示,17个CmbHLHs基因分布于12个bHLH亚家族.低温处理地被菊幼苗,qPCR分析发现,7个CmbHLHs基因受到低温胁迫诱导后表达量增加.本研究可为地被菊bHLH基因功能的进一步研究提供参考.
文献关键词：
地被菊;碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子;基因家族;低温胁迫
中图分类号：
作者姓名：
任镘蓉;全英杰;杨雯婷;何子涵;张佳凝;高日
作者机构：
延边大学农学院,延吉133002
文献出处：
引用格式：
[1]任镘蓉;全英杰;杨雯婷;何子涵;张佳凝;高日-.地被菊bHLH转录因子基因家族鉴定及其低温胁迫响应)[J].农业生物技术学报,2022(01):50-62
A类：
CmbHLHs,CmbHLH,CmbHLH8,CmbHLH15
B类：
地被菊,基因家族鉴定,低温胁迫响应,Chrysanthemum,morifolium,菊科,菊属,多年生,宿根,草本植物,花型,整齐,观赏价值,北方地区,basic,helix,loop,非生物胁迫,转录组数据,ORF,bp,预测分析,细胞核,蛋白二级结构,miRNA,基因转录,MEME,软件预测,保守基序,系统发育分析,基因分布,亚家族,低温处理,幼苗,qPCR,基因功能
AB值：
0.298815
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