典型文献
基于全基因组SNP高效鉴定燕麦种质资源
文献摘要：
为探究鉴别燕麦品种特异性所需SNP标记的最少数量与鉴别效果,以25个生产上大面积推广的栽培燕麦品种为材料,利用燕麦Illumina Inc.iSelect 6K微珠芯片进行基因分型,按照具有多态性、最小等位基因频率(MAF)大于0.05、缺失率小于0.50的条件进行筛选,获得2 214个高质量的SNP标记.所有SNP标记的平均MAF为0.75,平均多态性信息含量(PIC)为0.28.群体遗传结构分析将25个燕麦品种划分为5个类群.通过去冗余分析,获得8个能够高效鉴别燕麦参试品种的SNP标记.这8个SNP标记的平均MAF为0.62,平均PIC为0.35,表现出丰富的遗传多样性.测序结果显示,所筛选的8个SNP标记具有较好的稳定性和重现性.进一步利用这8个SNP标记构建了 25个燕麦栽培品种的SNP指纹图谱,为燕麦栽培品种真实性鉴定和纯度检测提供了可用的标记组合.
文献关键词：
燕麦(Avena saliva L.);SNP;品种鉴定;DNA指纹图谱
中图分类号：
作者姓名：
徐金青;边海燕;王寒冬;王蕾;张波;尤恩;李晓兰;陈文杰;沈裕虎
作者机构：
中国科学院高原适应与进化重点实验室/青海省作物分子育种重点实验室/青藏高原作物种质资源研究与利用实验室,中国科学院西北高原生物研究所,青海西宁810001;中国科学院种子创新研究院,青海西宁810001;中国科学院大学生命科学学院,北京100049
文献出处：
引用格式：
[1]徐金青;边海燕;王寒冬;王蕾;张波;尤恩;李晓兰;陈文杰;沈裕虎-.基于全基因组SNP高效鉴定燕麦种质资源)[J].麦类作物学报,2022(06):677-684
A类：
iSelect
B类：
全基因组,SNP,麦种,种质资源,燕麦品种,品种特异性,Illumina,Inc,6K,微珠,基因分型,等位基因频率,MAF,缺失率,多态性信息含量,PIC,群体遗传结构,遗传结构分析,类群,去冗,冗余分析,参试,遗传多样性,重现性,栽培品种,指纹图谱,品种真实性,真实性鉴定,纯度检测,Avena,saliva,品种鉴定
AB值：
0.366209
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
