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典型文献
基于SNP标记的橹稻与栽培稻的遗传多样性分析及萌发耐淹性评价
文献摘要:
旨在分析橹稻与栽培稻间的遗传多样性,为橹稻的保护和开发利用提供分子依据.以包括橹稻在内的48份水稻种质资源为试验材料,利用1K mGPS SNP芯片进行基因分型,使用PowerMaker 3.25软件进行UPGMA聚类分析.结果表明,4785对多态性SNP标记共检测出9570个等位基因,平均每对标记检测出2个等位变异;多态性信息含量(PIC)变化范围为0.0400~0.5957,平均值为0.3123,基因多样性指数(GD)变化范围为0.0408~0.6667,平均值为0.3839.UPGMA聚类分析将48份参试种质划分为2个亚群,即籼稻亚群和粳稻亚群,其中橹稻分属于粳稻亚群.厌氧萌发耐受性评价表明,橹稻具有很强的耐低氧萌发能力,可为适宜直播水稻的培育提供重要的种质基础,同时本研究为橹稻优异基因的挖掘和利用提供理论基础.
文献关键词:
橹稻;栽培稻;SNP;遗传多样性;萌发耐淹性
作者姓名:
孙志广;潘根;陈庭木;李景芳;赵利君;迟铭;徐波;邢运高;刘金波;刘晓敏;葛高宁;徐锦涛;王宝祥;徐大勇
作者机构:
连云港市农业科学院/江苏省现代作物生产协同创新中心,江苏连云港222006;中国农业科学院麻类研究所,长沙410000;南京农业大学生命科学学院,南京210095;苏州农业职业技术学院环境工程学院,江苏苏州215026
文献出处:
引用格式:
[1]孙志广;潘根;陈庭木;李景芳;赵利君;迟铭;徐波;邢运高;刘金波;刘晓敏;葛高宁;徐锦涛;王宝祥;徐大勇-.基于SNP标记的橹稻与栽培稻的遗传多样性分析及萌发耐淹性评价)[J].中国农学通报,2022(30):6-13
A类:
橹稻,萌发耐淹性,PowerMaker
B类:
SNP,栽培稻,遗传多样性分析,保护和开发,稻种,种质资源,1K,mGPS,基因分型,UPGMA,等位基因,标记检测,等位变异,多态性信息含量,PIC,变化范围,多样性指数,GD,参试,试种,亚群,籼稻,粳稻,分属,厌氧,耐受性评价,评价表,低氧萌发,直播水稻,异基因
AB值:
0.31497
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