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典型文献
络石藤中COX-2抑制成分的虚拟筛选与抗癫痫活性评价
文献摘要:
该文对络石藤中潜在作用于环氧合酶-2(cyclooxyganese-2,COX-2)靶点的活性物质进行研究,阐明其药效物质基础.该文采用以药效团为基础的虚拟筛选手段,通过收集已出版文献中报道的具有抑制COX-2活性的化合物信息,建立基于COX-2配体的HipHop药效团模型,收集文献中报道的络石藤中的成分并建立化合物库,对络石藤中的成分与药效团进行匹配,随后使用分子模拟对接手段对匹配到的小分子化合物与COX-2靶点(PDB ID:3LN1)进行对接并用分子模拟动力学方法对潜在活性单体与COX-2的作用进一步探讨.采用戊四唑(pentylenetetrazol,PTZ)点燃模型对活性单体牛蒡子苷元(arctige-nin,15)的抗癫痫作用进行测定,并对COX-2水平的调控作用进行评价.通过文献检索建立包含络石藤中所含化学成分118种的化合物库,随后通过测试集验证选出优选药效团04用于对络石藤化合物库的虚拟筛选,经过匹配后得到6种络石藤中潜在的COX-2抑制成分.随后通过分子模拟对接分析了 5种化合物与COX-2及COX-1的作用情况,对其中2种化合物进行10 ns分子动力学模拟,化合物15能够在中、高剂量下延长PTZ致癫痫发作的潜伏时间,改善PTZ所致的焦虑抑郁样行为,降低COX-2表达水平,减少海马CA1区内COX-2免疫阳性细胞数.结果表明基于虚拟筛选与活性评价手段探讨络石藤中COX-2抑制作用的成分具有一定的准确性.
文献关键词:
络石藤;COX-2;虚拟筛选;活性评价
作者姓名:
赵泽丰;年梦;姬晓彤;吕红;乔海法;杨晓航;钱明成
作者机构:
陕西中医药大学针灸推拿学院,陕西西咸新区712046;陕西省针药结合重点实验室,陕西西咸新区712046;重庆市江津区中医院 肾病风湿免疫科,重庆402260;常州大学制药与生命科学学院,江苏常州213164
文献出处:
引用格式:
[1]赵泽丰;年梦;姬晓彤;吕红;乔海法;杨晓航;钱明成-.络石藤中COX-2抑制成分的虚拟筛选与抗癫痫活性评价)[J].中国中药杂志,2022(14):3863-3875
A类:
cyclooxyganese,3LN1,arctige
B类:
络石藤,COX,虚拟筛选,抗癫痫,活性评价,潜在作用,环氧合酶,活性物质,药效物质基础,选手,中报,HipHop,药效团模型,分子模拟,模拟对接,接手,配到,小分子化合物,PDB,ID,戊四唑,pentylenetetrazol,PTZ,点燃,牛蒡子苷元,nin,文献检索,所含,含化,测试集,ns,分子动力学模拟,高剂量,癫痫发作,焦虑抑郁,抑郁样行为,少海,海马,CA1,阳性细胞,评价手段
AB值:
0.277432
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