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数字液滴PCR图像的荧光信息提取
文献摘要：
针对数字液滴聚合酶链式反应(droplet digital Polymerase Chain Reaction,ddPCR)核酸检测中数字聚合酶链式反应由液滴数量多、尺寸小、排列紧密、荧光强度不均匀而导致的液滴难以计数问题,提出一种图像处理方法,基于灰度遍历法采集图像的信息,通过微分分析法对液滴进行分类和计数,可准确采集ddPCR实验的图像信息.通过卷积算法去除图像中的噪声,使用灰度分布均衡化法增强图像的对比度.以灰度遍历的方式将图像在逐个阈值下二值化,并以几何条件为限制统计液滴数量.通过微分分析法对数据进行分析,得出荧光液滴与全部液滴的计数结果.在以人类gDNA(genomic DNA)为检测样本的ddPCR实验中,该算法的平均检测准确率为99.36％,与商用仪器算法和同类算法相比分别提高了2.24％,2.53％.该方法为ddPCR实验提供了可靠的检测结果,可更好地适用于ddPCR实验.
文献关键词：
荧光斑点检测;数字液滴PCR;核酸检测;图像处理;图像分析
中图分类号：
作者姓名：
李姗姗;王子超;于成壮;魏春阳;李军委
作者机构：
河北工业大学机械工程学院,天津300401;河北省智能传感与人机融合重点实验室,天津300130;电工装备可靠性与智能化国家重点实验室,天津300132;河北工业大学生物物理研究所,天津300401
文献出处：
引用格式：
[1]李姗姗;王子超;于成壮;魏春阳;李军委-.数字液滴PCR图像的荧光信息提取)[J].光学精密工程,2022(07):821-829
A类：
荧光斑点检测
B类：
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AB值：
0.408581
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