典型文献
团头鲂foxO基因家族的序列特征及表达分析
文献摘要：
为了研究鱼类foxO(Forkhead box O)基因的功能,基于组学测序及PCR扩增获得了团头鲂(Megalobrama amblycephala)foxO家族7个基因,foxO1a/b、foxO3a/b、foxO4和foxO6a/b的编码序列,分别为1965、1892、1929、1959、1878、1803和2157 bp.SMART结构域分析显示该家族基因属于典型的FoxO家族蛋白,具有保守的Forkhead、FOXO_KIX_bdg和FOXO-TAD结构域.系统进化分析显示,团头鲂FoxO与其他鲤科鱼类的同源基因具有较高的相似性.基于qPCR分析显示7个基因在所检测的9个组织中均有表达,但在各组织间存在表达差异,其中foxO4在血液中表达量最高,foxO6a在肝脏中表达量最高,而foxO6b在脑中表达量最高.在胚胎早期发育过程中,foxO1a和foxO1b、foxO3a和foxO3b、foxO6a和foxO6b的表达模式类似;而foxO4在发育早期,除了体节出现期、眼色素沉淀晚期、体节生成期和受精后10d表达量高外,其他时期表达量都比较低.经急性低氧处理后,团头鲂foxO家族基因的表达水平在所检测的大部分组织中呈现显著上调趋势,尤其是在肌肉组织中.基于JASPAR分析显示foxO家族基因都包含有Hif-1α结合位点,利用双荧光素酶报告系统对foxO1b启动子进行了验证,发现该基因受到Hif-1α调控.这些结果说明foxO基因可能通过Hif-1α介导的途径在团头鲂低氧应激中发挥重要作用.
文献关键词：
foxO基因家族;基因表达;低氧;团头鲂
中图分类号：
作者姓名：
张阿鑫;陈康;王伟峰;刘红;王焕岭
作者机构：
华中农业大学水产学院,农业农村部淡水生物繁育重点实验室,武汉 430070;华中农业大学水产养殖实验教学中心,武汉 430070
文献出处：
引用格式：
[1]张阿鑫;陈康;王伟峰;刘红;王焕岭-.团头鲂foxO基因家族的序列特征及表达分析)[J].水生生物学报,2022(11):1684-1693
A类：
foxO,foxO1a,foxO3a,foxO4,foxO6a,KIX,bdg,foxO6b,foxO1b,foxO3b
B类：
团头鲂,基因家族,序列特征,表达分析,鱼类,Forkhead,box,Megalobrama,amblycephala,编码序列,bp,SMART,结构域,家族基因,FoxO,FOXO,TAD,系统进化分析,鲤科,同源基因,qPCR,表达差异,胚胎早期发育,表达模式,体节,现期,眼色,色素沉淀,受精,10d,急性低氧,肌肉组织,JASPAR,Hif,结合位点,双荧光素酶报告系统,启动子,低氧应激
AB值：
0.28905
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