目的:基于非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)与良性肺结节(benign pulmonary nod-ules,BPN)患者血浆蛋白质组学分析,寻找良恶性肺结节鉴别诊断相关蛋白标志物.方法:采用非标记定量蛋白质组学技术,以10例BPN患者为对照,对10例肺鳞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)、10例肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)患者进行血浆蛋白质组学分析.对不同比较组间的可定量蛋白进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA).以差异倍数＞1.2(上调)或＜1/1.2(下调)且P＜0.05为标准筛选差异蛋白.应用String网站和R语言对差异蛋白进行基因本体论(gene ontology,GO)分析和主成分分析(principal component analysis,PCA).结果:LUSC组与BPN组间比较发现380个可定量蛋白,其中20个差异蛋白.GSEA结果显示,可定量蛋白主要富集在肿瘤坏死因子信号通路、代谢途径、碳代谢等通路(P＜0.05).PCA结果显示,差异蛋白可明显区分LUSC与BPN患者.GO分析结果表明,20种差异蛋白大多以细胞外泌体的形式存在或主要位于细胞外间隙和胞外区,且主要富集于组织重塑的调节、细胞黏附等的生物学过程以及肝素结合、肽链内切酶抑制剂活性等的分子功能.LUAD组与BPN组间比较共得到350个可定量蛋白,包含12个差异蛋白.GSEA分析发现,其显著富集的通路有细胞因子与细胞因子受体的相互作用、趋化因子信号通路、代谢途径等(P＜0.05).PCA结果同样显示,差异蛋白可明显区分LUAD和BPN患者.GO分析结果表明,该12种差异蛋白主要富集于有机循环复合物应答的生物学过程和芳香酯酶活性的分子功能;细胞定位分析发现,其大多也以细胞外泌体的形式存在或主要位于细胞外间隙和胞外区.结论:良恶性肺结节患者血浆蛋白存在明显差异,可为发现良恶性肺结节鉴别诊断的新型标志物提供线索.

良恶性肺结节;血浆;非标记定量蛋白质组学;新型蛋白标志物

孙慧芳;张雪;欧阳松云;代丽萍

郑州大学第一附属医院放射科,河南 郑州 450052;郑州大学河南省医药科学研究院肿瘤研究所,河南 郑州 450052;郑州大学第一附属医院呼吸与危重症睡眠医学科,河南 郑州 450052

现代肿瘤医学

[1]孙慧芳;张雪;欧阳松云;代丽萍-.非小细胞肺癌与良性肺结节非标记定量血浆蛋白质组学分析)[J].现代肿瘤医学,2022(15):2732-2738

新型蛋白标志物

非小细胞肺癌,血浆蛋白,组学分析,small,cell,lung,cancer,NSCLC,benign,pulmonary,nod,ules,BPN,良恶性肺结节,结节鉴别,鉴别诊断,非标记定量蛋白质组学,蛋白质组学技术,肺鳞癌,squamous,LUSC,肺腺癌,adenocarcinoma,LUAD,行血,基因集富集分析,gene,set,enrichment,analysis,GSEA,倍数,差异蛋白,String,基因本体论,ontology,principal,component,肿瘤坏死因子信号通路,代谢途径,碳代谢,种差,细胞外泌体,细胞外间隙,胞外区,组织重塑,细胞黏附,生物学过程,肝素,肽链,内切,酶抑制剂,细胞因子受体,趋化因子,复合物,芳香,酯酶活性,细胞定位,定位分析,提供线索

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