典型文献
非小细胞肺癌中WASF1基因与免疫细胞浸润的相关性分析
文献摘要:
目的 探讨WASF1在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达,及其与NSCLC预后和免疫细胞浸润水平的相关性.方法 分析TCGA数据库中NSCLC和癌旁正常组织中WASF1 mRNA的表达,应用R语言limma分析WASF1 mRNA表达差异.采用TIMER数据库分析NSCLC组织中WASF1 mRNA的表达,采用qRT-PCR和免疫组化法检测NSCLC组织中WASF1 mRNA和蛋白的表达.利用OncoLnc和TIMER数据库分析WASF1对NSCLC患者预后及免疫细胞浸润水平的影响;应用GSEA软件预测WASF1可能参与的信号通路.结果 与癌旁正常组织相比,WASF1在NSCLC组织中高表达,且影响NSCLC患者预后(P<0.05).肺腺癌中WASF1 mRNA表达与巨噬细胞(r=0.131,P<0.01)、中性粒细胞(r=0.207,P<0.01)和树突状细胞(r=0.093,P<0.05)的免疫浸润水平呈正相关,WASF1的拷贝数变异对B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平均有影响(P<0.05).B细胞浸润可作为肺腺癌的独立预后因素(HR=0.013,95%CI=0.001~0.187).肺鳞状细胞癌中WASF1 mRNA表达与细胞纯度呈正相关(r=0.275,P<0.01),与CD8+T细胞(r=-0.138,P<0.01)、CD4+T细胞(r=-0.132,P<0.01)、巨噬细胞(r=-0.149,P<0.01)、中性粒细胞(r=-0.247,P<0.01)和树突状细胞(r=-0.186,P<0.01)的免疫浸润水平呈负相关,WASF1的拷贝数变异对B细胞、CD4+T细胞、中性粒细胞和树突状细胞的浸润水平有影响(P<0.05).GSEA分析显示WASF1可能通过影响细胞周期、核苷酸切除修复和DNA复制等信号通路,从而导致NSCLC的进展.结论 WASF1在NSCLC中高表达,影响NSCLC预后和肿瘤免疫细胞浸润水平.WASF1可能通过多条通路调控NSCLC的发生、发展.
文献关键词:
肺肿瘤;非小细胞肺癌;WASF1;预后;免疫浸润水平;生物学标志物
中图分类号:
作者姓名:
仵红娇;刘春玲;金叶;李昂;吴凤君;谢俞宁;张志;张雪梅
作者机构:
华北理工大学公共卫生学院,唐山 063210;华北理工大学命科学学院,唐山 063210;华北理工大学附属唐山市人民医院,唐山 063001;华北理工大学附属唐山市工人医院,唐山 063003
文献出处:
引用格式:
[1]仵红娇;刘春玲;金叶;李昂;吴凤君;谢俞宁;张志;张雪梅-.非小细胞肺癌中WASF1基因与免疫细胞浸润的相关性分析)[J].临床与实验病理学杂志,2022(08):936-942
A类:
WASF1
B类:
非小细胞肺癌,small,cell,lung,cancer,NSCLC,TCGA,癌旁,正常组织,limma,表达差异,TIMER,数据库分析,qRT,免疫组化法,OncoLnc,GSEA,软件预测,肺腺癌,巨噬细胞,树突状细胞,免疫浸润水平,拷贝数变异,CD8+T,CD4+T,独立预后因素,肺鳞状细胞癌,细胞周期,核苷酸切除修复,肿瘤免疫细胞浸润,多条,肺肿瘤,生物学标志物
AB值:
0.179276
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