典型文献
基于叶绿体基因组分析我国苜蓿属植物演化路径
文献摘要:
全球苜蓿属植物约87种,我国有15种,大多为广布种,可生活在不同的生境当中.该属植物由于荚果等形态变异复杂,繁育系统多样,其进化历史一直是本领域关注的热点问题之一.随着分子生态学的发展,利用基因组学的方法解决生态学问题不断报道,但目前我国苜蓿属物种的叶绿体基因组数据缺乏,有关其演化路径的研究尚少有开展.为此,选取了我国苜蓿属10个代表物种和胡卢巴属1种,测序比较其叶绿体基因组结构特征,基于叶绿体基因组和核ITS序列构建分析其系统发育关系,并结合物种地理分布生境特征探究我国苜蓿属植物的演化路径.结果显示,以上苜蓿属植物的叶绿体基因组大小为121-127 kb,均为非典型的"四区"结构,缺失反向重复区.在10个苜蓿属物种的叶绿体基因组中共检测到1,273个SSR位点,这些SSR位点可以作为潜在的分子标记用于我国苜蓿属植物资源的鉴定.供试苜蓿属物种的叶绿体基因组共发生6次基因倒位.天蓝苜蓿的2个倒位发生在基因atpB到ycf3,ndhC到trnLUAA之间的区域;青海苜蓿和花苜蓿的叶绿体基因组共享4个倒位,分别位于基因psbM到psaA、ndhB到tmNGUU、ndhB到rpoA以及clpP到rpl20区间.天蓝苜蓿中还存在clpP、rpoC1和atpF基因内含子的丢失现象.基于叶绿体基因组及ITS序列构建的苜蓿属系统发育关系,支持传统上将苜蓿属划分为紫苜蓿组、南苜蓿组、阔荚苜蓿组和天蓝苜蓿组的分类处理.其中,直果胡卢巴、单花胡卢巴与毛荚苜蓿形成一支,位于系统树的基部,支持中国苜蓿属和胡卢巴属之间存在过渡类型"类苜蓿植物"的观点.分析我国苜蓿属植物的分化原因可能与这些物种的生境有关,特别是年平均温度可能是导致苜蓿物种分化的决定性因素.
文献关键词:
苜蓿属;叶绿体基因组;结构变异;系统发育;生态进化
中图分类号:
作者姓名:
王晓娟;董文攀;周世良
作者机构:
上海科技馆,上海自然博物馆自然史研究中心,上海 200127;北京林业大学生态与自然保护学院,北京 100083;中国科学院植物研究所,系统与进化植物学国家重点实验室,北京 100093
文献出处:
引用格式:
[1]王晓娟;董文攀;周世良-.基于叶绿体基因组分析我国苜蓿属植物演化路径)[J].生态学报,2022(15):6125-6136
A类:
ndhC,trnLUAA,psbM,tmNGUU,毛荚苜蓿
B类:
叶绿体基因组,基因组分析,苜蓿属植物,演化路径,广布,荚果,形态变异,繁育系统,进化历史,分子生态学,基因组学,基因组数据,数据缺乏,基因组结构,ITS,构建分析,系统发育关系,结合物,种地,地理分布,生境特征,基因组大小,kb,非典型,四区,重复区,SSR,分子标记,植物资源,倒位,天蓝,atpB,ycf3,psaA,ndhB,rpoA,clpP,rpl20,rpoC1,atpF,内含子,上将,紫苜蓿,分类处理,单花,基部,年平均温度,物种分化,结构变异,生态进化
AB值:
0.293564
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