典型文献
miRNA let7对小鼠脑组织基因表达谱的影响研究
文献摘要：
目的 研究miRNA let7的分子作用机制.方法 从GEO数据库下载数据集GSE60848,该数据集包含了两对let7敲低的小鼠脑组织样本和两对正常脑组织样本.采用GEO2R工具对其进行差异基因表达分析,筛选出差异表达的候选基因,并采用DAVID在线数据库对候选基因进行GO和KEGG富集分析.采用STRING数据库构建蛋白互作网络,并采用Cyotoscape软件对其结果进行可视化处理,进一步筛选出关键基因,并构建相应调控子网络.结果 分析筛选得到77个具有显著表达差异的基因,其中68个显著上调基因,7个显著下调基因.上述差异表达的基因主要发挥免疫应答、抗原递呈、三磷酸鸟苷(GTP)酶活性、GTP连接等生物功能,并显著富集在糖代谢、细胞黏附、抗原加工提呈、吞噬小体等信号通路中.通过分析let7-mRNA调控网络,最终筛选得到发挥核心调控作用的10个关键基因.结论 let7对生物系统发挥广谱且有效的调控作用,其机制可能是通过靶向调控TRIM30A、GBP3、PARP14、IFIT2等基因来发挥生物学功能.
文献关键词：
基因芯片;表达谱;微小RNA;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
伊力亚斯·艾萨;卡哈尔江·艾力;阿布力米提·麦提图荪;付瑾
作者机构：
新疆维吾尔医学专科学校药学系,新疆和田 848000
文献出处：
引用格式：
[1]伊力亚斯·艾萨;卡哈尔江·艾力;阿布力米提·麦提图荪;付瑾-.miRNA let7对小鼠脑组织基因表达谱的影响研究)[J].现代医药卫生,2022(18):3113-3117
A类：
let7,GSE60848,Cyotoscape,TRIM30A,GBP3,PARP14
B类：
miRNA,小鼠脑组织,基因表达谱,分子作用机制,下载数据,两对,敲低,GEO2R,差异基因表达分析,出差,差异表达,候选基因,DAVID,富集分析,STRING,数据库构建,蛋白互作网络,可视化处理,关键基因,子网络,选得,表达差异,免疫应答,抗原递呈,三磷,鸟苷,GTP,生物功能,糖代谢,细胞黏附,抗原加工,吞噬,小体,调控网络,生物系统,广谱,靶向调控,IFIT2,生物学功能,基因芯片
AB值：
0.340723
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