典型文献
长链非编码RNA LINC01355在神经母细胞瘤复发过程中的表达变化及意义
文献摘要：
目的:探讨神经母细胞瘤(NB)复发过程中长链非编码RNA(lncRNA) LINC01355的表达及作用机制。方法:在TARGET数据库检索NB数据集，进行差异表达分析筛选差异表达的lncRNA并进行生物信息学分析。荧光实时定量反转录-聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测20例原发NB组织及10例复发NB组织中部分差异分子的表达，对数据库结果进行验证，组间比较采用 t检验。 结果:LINC01355在复发NB组织中表达水平(1.935±1.242)明显低于原发肿瘤组织(6.800±5.107， Z＝3.395， P<0.01)。将患者按LINC01355表达的中位数分为两个亚组，并使用Kaplan-Meier方法估算这两个亚组的总生存时间，结果表明，LINC01355高表达对应患者预后情况较好( χ2＝6.002， P<0.05)。应用Starbase 3.0数据库分析LINC01355的靶基因及功能，GO富集分析结果显示LINC01355调控的靶基因参与了自噬调节、神经元凋亡过程、类固醇生物合成等过程；京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示LINC01355及其靶基因参与了乏氧诱导因子-1α(HIF-1α)通路的调控。对LINC01355及其靶基因法尼基二磷酸法尼基转移酶1(FDFT1) mRNA在原发及复发NB组织中表达进行验证，结果发现复发NB组织中LINC01355表达(0.926±0.223)低于原发肿瘤(2.695±1.036， t＝-5.294， P<0.01)；复发NB组织中FDFT1 mRNA表达(3.989±1.996)高于原发肿瘤(1.505±0.680， t＝5.079， P<0.01)；在原发及复发NB组织中LINC01355与FDFT1 mRNA表达呈负相关( rs＝-0.826、-0.900， P<0.01)。 结论:LINC01355可用于预测NB患者的预后，与肿瘤复发有关。LINC01355的表达降低导致FDFT1表达增高可能是NB复发的重要原因。
文献关键词：
神经母细胞瘤;长链非编码RNA;生物信息学;预后
中图分类号：
作者姓名：
耿建磊;王晓宇;赵力搏;段菲;王朝龙;牛会忠
作者机构：
河北省儿童医院普外一科，石家庄 050031;河北省人民医院麻醉科，石家庄 050051;河北省儿童医院检验科，石家庄 050031
文献出处：
引用格式：
[1]耿建磊;王晓宇;赵力搏;段菲;王朝龙;牛会忠-.长链非编码RNA LINC01355在神经母细胞瘤复发过程中的表达变化及意义)[J].中华实验外科杂志,2022(04):716-719
A类：
LINC01355,FDFT1
B类：
长链非编码,神经母细胞瘤,表达变化,NB,lncRNA,TARGET,数据库检索,差异表达分析,生物信息学分析,实时定量,聚合酶链反应,qPCR,组织中表达,原发肿瘤,肿瘤组织,中位数,Kaplan,Meier,总生存时间,预后情况,Starbase,数据库分析,靶基因,富集分析,自噬,神经元凋亡,类固醇,生物合成,京都基因与基因组百科全书,乏氧,氧诱导,诱导因子,HIF,二磷酸,磷酸法,法尼基转移酶,rs,肿瘤复发,发有
AB值：
0.226235
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
