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典型文献
细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)与乳腺癌发生、发展和转移的生物信息学分析
文献摘要:
目的 利用生物信息学方法研究细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)介导乳腺癌的潜在靶向基因、信号传导通路及分子机制.方法 从GEO和TCGA数据库下载正常乳腺组织和乳腺癌样本的基因芯片;使用R软件limma包分析正常乳腺组织和乳腺癌样本之间的差异表达基因;使用Kaplan-Meier Plotter评估乳腺癌患者的整体生存率、无复发生存率和无远处转移生存率;对筛选出的差异表达基因进行GO和K EGG信号通路富集分析.结果 通过对差异表达基因的趋势分析,筛选出2015个显著上调的基因以及864个显著下调的基因,其中CDCA1/2/3/5/7/8可能为介导乳腺癌浸润性进展的相关基因.生存分析表明,乳腺癌CDCA1/2/3/5/7/8高表达与不良预后相关(均P<0.05).GO分析结果主要富集于细胞有丝分裂周期、染色姐妹单体分离、染色体、着丝粒、纺锤体等;KEGG信号通路富集分析则在卵母细胞减数分裂、p53信号通路、DNA复制显著富集.结论 整合生物信息学分析结果,表明CDCAs在乳腺癌组织中表达升高,并且CDCAs表达水平显著影响乳腺癌患者预后,与其他CDCAs相比,CDCA2/3/5/8可能是乳腺癌患者靶向治疗的合适靶点.
文献关键词:
乳腺癌;细胞分裂周期相关蛋白;生物信息学
作者姓名:
刘婧婷;隆建萍;金凤玲;林碧玉;王文第;裴建赢;王晶晶
作者机构:
兰州大学第一临床学院,兰州 730000;甘肃省妇幼保健院妇幼保健科研中心,兰州 730050;甘肃省妇幼保健院乳腺一科,兰州 730050;兰州大学第一医院感染管理科,兰州 730000
引用格式:
[1]刘婧婷;隆建萍;金凤玲;林碧玉;王文第;裴建赢;王晶晶-.细胞分裂周期相关蛋白(CDCAs)与乳腺癌发生、发展和转移的生物信息学分析)[J].华中科技大学学报(医学版),2022(02):172-179
A类:
CDCAs
B类:
细胞分裂周期相关蛋白,生物信息学分析,利用生物,生物信息学方法,信号传导通路,GEO,TCGA,下载,常乳,乳腺组织,基因芯片,limma,包分析,差异表达基因,Kaplan,Meier,Plotter,乳腺癌患者,无复发生存率,远处转移,信号通路富集,通路富集分析,CDCA1,浸润性,生存分析,不良预后,有丝分裂,姐妹,着丝粒,纺锤体,卵母细胞,减数分裂,p53,整合生物信息学,癌组织,组织中表达,CDCA2,靶向治疗
AB值:
0.26832
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