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典型文献
LINC01215在结直肠癌组织中的表达及其临床意义
文献摘要:
目的 探讨LINC01215在结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织中的表达及其临床意义.方法 利用TCGA数据库分析LINC01215在CRC组织及其癌旁正常组织中的表达,并分析其与预后的关系;采用RT-qPCR检测2009年3月至2012年1月在广州医科大学附属第二医院诊治的137例CRC患者癌组织及其癌旁正常组织中LINC01215的表达水平,并分析其与患者临床病理特征的关系.通过MEM网站获取LINC01215靶基因并进行GO注释和KEGG分析.基于富集结果,对LINC01215进行单样本基因集富集分析(ssGSEA)和药物敏感性分析.结果 TCGA数据库分析结果显示,LINC01215在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织(P<0.001).临床标本验证结果显示,LINC01215在CRC组织中的表达水平低于癌旁正常组织(P=0.001),且与组织分化程度相关(P=0.037).TCGA数据库分析结果显示,LINC01215高表达组的中位总生存时间明显高于LINC01215低表达组[96个月(95%CI:80~113个月)vs82个月(95%CI:70~95个月),P=0.002].LINC01215低表达是CRC预后不良的危险因素(HR=1.69,95%CI:1.13~2.51,P=0.010).GO和KEGG富集分析显示,LINC01215相关的靶基因主要参与蛋白质结合、T细胞受体等信号通路,ssGSEA显示LINC01215与28种免疫细胞相关(均P<0.05).药物敏感性分析显示 LINC01215 与 Chelerythrine、Sapacitabine、Fenretinide、Hydroxyurea等药物敏感性有关(均P<0.05).结论 LINC01215在CRC中低表达且与预后不良相关,其可能通过参与调节T细胞受体等信号通路影响CRC发生发展过程.
文献关键词:
结直肠癌;长链非编码RNA;LINC01215;生物信息学;免疫浸润
作者姓名:
谢晨;李智;吕嘉春;魏宜胜;彭铁立
作者机构:
511436广州 广州医科大学公共卫生学院;510260广州 广州医科大学附属第二医院胃肠外科;511518清远 广州医科大学附属第六医院消化内科
引用格式:
[1]谢晨;李智;吕嘉春;魏宜胜;彭铁立-.LINC01215在结直肠癌组织中的表达及其临床意义)[J].中国癌症防治杂志,2022(03):294-300
A类:
LINC01215,Chelerythrine,Sapacitabine,Fenretinide,Hydroxyurea
B类:
结直肠癌组织,colorectal,cancer,CRC,TCGA,数据库分析,癌旁,正常组织,qPCR,广州医科大学,临床病理特征,MEM,靶基因,集结,单样本,基因集富集分析,ssGSEA,药物敏感性分析,临床标本,组织分化,分化程度,总生存时间,低表达,vs82,预后不良,蛋白质结合,细胞受体,免疫细胞,良相,长链非编码,免疫浸润
AB值:
0.194782
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