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一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征分析
文献摘要：
目的:分析一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征。方法:肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy分离自我院血液科一位患者的粪便标本，使用仪器BD Phenix-M50鉴定菌株并测定最小抑菌浓度；酶联免疫层析试验和PCR方法检测碳青霉烯酶基因型；接合试验检测相关质粒的转移性；PacBio和Illumina平台对菌株全基因组测序，并在BacWGSTdb数据库中检索菌株MLST分型、耐药基因和质粒类型，使用软件Easyfig_2.2.3比对基因组和开放读码框序列，BRIG v0.95生成可视化质粒圈图。结果:肺炎克雷伯菌KPN-hnqyy对碳青霉烯类抗生素耐药，MLST分型为ST11型，
blaKPC-2和
blaNDM-5碳青霉烯酶基因阳性；接合子
blaKPC-2基因阳性，
blaNDM-5阴性；全基因组测序显示菌株含有1个染色体和3个质粒；肺炎克雷伯菌KP69和KP19-2029等与本研究菌株染色体基因组相似性大于99.9%，且其各自携带的不同种类的质粒上含有相似的IncR和IncFⅠ耐药基因融合区，
blaKPC-2基因位于此融合区中一个由Tn3-△Tn4401-Tn1721/Tn1722序列演化而来的两端插入IS26转座酶基因的结构中；
blaNDM-5基因位于一种含有噬菌体插入片段特殊质粒的Ⅰ型转座子上，两端也插入了IS26转座酶基因。
结论:ST11型肺炎克雷伯菌携带
blaKPC-2的IncR和IncFⅡ耐药基因融合区与染色体基因组可能一起广泛存在，特殊质粒携带的
blaNDM-5基因可能是通过IS26转座元件介导的基因重组方式偶然获得；携带
blaKPC-2基因的ST11型肺炎克雷伯菌在中国广泛传播并能通过IS26转座元件获得其他碳青霉烯酶基因的能力应引起重视。
文献关键词：
肺炎克雷伯菌;KPC-2;NDM-5;β-内酰胺酶
中图分类号：
作者姓名：
肖伟强;屈元晔;王小昆;孙明月;常彦敏;许青霞;毕利军
作者机构：
郑州大学附属肿瘤医院检验科，郑州 450007;郑州市消化系统肿瘤标志物诊断重点实验室，郑州 450007;中国科学院生物物理所佛山分所，佛山 528000
文献出处：
引用格式：
[1]肖伟强;屈元晔;王小昆;孙明月;常彦敏;许青霞;毕利军-.一株同时产KPC-2和NDM-5碳青霉烯酶的肺炎克雷伯菌耐药基因特征分析)[J].中华微生物学和免疫学杂志,2022(09):669-675
A类：
hnqyy,Phenix,BacWGSTdb,Easyfig,BRIG,KP69,KP19,Tn3,Tn4401,Tn1721,Tn1722
B类：
一株,肺炎克雷伯菌,耐药基因,基因特征分析,KPN,我院,血液科,粪便标本,BD,M50,最小抑菌浓度,免疫层析,碳青霉烯酶基因,基因型,接合,试验检测,质粒,转移性,PacBio,Illumina,全基因组测序,MLST,读码,v0,圈图,碳青霉烯类抗生素,抗生素耐药,ST11,blaKPC,blaNDM,合子,染色体基因,IncR,IncF,基因融合,IS26,转座酶,噬菌体,转座子,转座元件,基因重组,重组方式,偶然,广泛传播,内酰胺酶
AB值：
0.225078
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