典型文献
大豆长链非编码RNA lncRNA77580转基因材料的转录组分析
文献摘要：
长链非编码RNAs(lncRNAs,long non-coding RNAs)是长度在200个核苷酸以上的功能性RNA分子,在植物的生长发育及逆境应答中发挥重要调控功能.前期研究发现一个大豆盐胁迫响应lncRNA,称其为lncRNA77580,它的大片段缺失和过表达影响其邻近蛋白编码基因的表达.本研究通过lncRN477580转基因材料的转录组分析,探究lncRNA 77580可能的功能及调控网络.在大豆发状根中过表达lncRNA77580,转基因复合体表现为盐敏感;利用dual-sgRNA/Cas9成功实现lncRNA77580大于4kb的大片段敲除,突变效率为12.5％.利用lncRNA77580转基因材料进行RNA-seq分析发现,lncRNA477580过表达和大片段缺失显著改变了转基因发状根的基因表达谱.差异表达基因(DEGs,differentially expressed genes)GO和KEGG富集分析表明,lncRNA77580过表达或敲除主要影响了大量转录因子和信号传导类基因的差异表达,这些差异表达基因与植物逆境应答及生长发育密切相关.上述结果说明lncRNA77580可能是在大豆逆境胁迫响应及生长发育过程中具有重要功能的一个长链非编码RNA.
文献关键词：
大豆;长链非编码RNA;转录组分析;逆境胁迫;基因编辑;发状根
中图分类号：
作者姓名：
牛风娟;陈向前;高飞;孙现军;胡正;张惠媛;王丽侠;姜奇彦;张辉
作者机构：
中国农业科学院作物科学研究所,北京100081;中央民族大学生命与环境科学学院,北京100081
文献出处：
引用格式：
[1]牛风娟;陈向前;高飞;孙现军;胡正;张惠媛;王丽侠;姜奇彦;张辉-.大豆长链非编码RNA lncRNA77580转基因材料的转录组分析)[J].植物遗传资源学报,2022(03):842-856
A类：
lncRNA77580,lncRN477580,4kb,lncRNA477580
B类：
大豆,长链非编码,转基因,因材,转录组分析,lncRNAs,long,coding,逆境应答,调控功能,前期研究,盐胁迫,大片,过表达,蛋白编码,编码基因,调控网络,发状根,复合体,盐敏感,dual,sgRNA,Cas9,敲除,变效,seq,基因表达谱,差异表达基因,DEGs,differentially,expressed,genes,富集分析,信号传导,逆境胁迫响应,重要功能,基因编辑
AB值：
0.253844
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