典型文献
使用GWAS和Meta-GWAS鉴定与猪甘油三酯含量相关候选基因
文献摘要：
本实验旨在挖掘影响猪甘油三酯(TG)含量的有效SNP位点以及候选基因,为生产优良猪肉的选育工作提供理论依据.收集Beadchips 60K SNP芯片分型莱芜猪、二花脸猪和杜洛克×(长白×约克郡)(DLY)群体共1256头猪的数据,并运用FarmCPU模型对1256头猪的TG含量进行全基因组关联分析(Genome-Wide Association Study,GWAS)及Meta-GWAS分析.GWAS分析结果显示:共检测到32个与TG含量相关的SNP位点,其中莱芜猪中有6个(P<1.8×10-5),二花脸猪中有8个(P<1.8×10-5),DLY中有18个(P<1.8×10-5);Meta-GWAS分析结果显示:发现2个与TG含量相关的新SNP位点;并利用Ensembl数据库,在显著SNP位点上下游0.5 Mb区域内进行基因鉴定,一共发现8个与TG含量调控有关的候选基因,其中在莱芜猪中发现的基因为PDCD6IP;在二花脸猪中发现的基因为CD24、ADGRF5和ADAMTS5;在DLY中发现的基因为DMRTA1、RPS6、TPP2、TEX36.本实验结果将会为解析猪的生长发育以及调控猪的TG含量提供思路.
文献关键词：
猪;全基因组关联分析;Meta-GWAS分析;甘油三酯
中图分类号：
作者姓名：
韦怡林;张力戈;张松源;詹凤婷;李秀领;乔瑞敏;韩雪蕾;李新建;王克君
作者机构：
河南农业大学动物科技学院,河南郑州 450046
文献出处：
引用格式：
[1]韦怡林;张力戈;张松源;詹凤婷;李秀领;乔瑞敏;韩雪蕾;李新建;王克君-.使用GWAS和Meta-GWAS鉴定与猪甘油三酯含量相关候选基因)[J].中国畜牧杂志,2022(08):113-120
A类：
Beadchips,FarmCPU,PDCD6IP,ADGRF5,DMRTA1,TPP2,TEX36
B类：
GWAS,甘油三酯,候选基因,SNP,猪肉,选育,60K,莱芜猪,二花脸猪,杜洛克,长白,约克郡,DLY,全基因组关联分析,Genome,Wide,Association,Study,Ensembl,上下游,Mb,基因鉴定,一共,含量调控,CD24,ADAMTS5,RPS6
AB值：
0.277068
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