典型文献
2017-2019年贵州省BV系流感病毒的分子特征分析
文献摘要:
目的 了解贵州省BV系流感暴发疫情和重症病例毒株的分子特征,探讨其特异性分子靶标,为流感的防控提供依据.方法 选取贵州省2017-2019年BV系流感暴发疫情、重症病例和普通流行毒株,经基因组的提取、HA和NA基因的扩增与测序,与参考株一起进行分子特征分析.结果 贵州省所有毒株HA和NA基因进化树拓扑结构类似,整体上毒株处于3个分支,2017年的毒株聚集为一簇,2018年的分散存在,2019年的处于两个分支且相对较远,绝大部分暴发疫情毒株和重症病例毒株均处于分支1.贵州省所有毒株同疫苗株B/Colorado/06/2017 HA和NA基因同源性最高,分别为98.6%~99.3%和98.9%~99.4%;2017年BV系毒株间HA和NA基因同源性分别为99.9%和99.9%~100%,2018年分别为98.4%~99.3%和98.7%~99.1%,2019年分别为97.7%~100%和98.4%~99.9%,其中2019年分支2中的毒株间同源性分别为99.4%~100%和99.6%~99.9%,分支1中的分别为99.5%~100%和99.3%~99.9%,所有暴发疫情、重症病例毒株同当年度普通流行毒株之间同源性均高于99.4%;与疫苗株B/Colorado/06/2017相比所有毒株HA基因均存在S14N、G144D、V195I、K513R的突变,NA基因均存在Q371K、D490N的突变;2019年分支1中的毒株HA基因存在G148R、K151E和T563A以及NA基因存在A395T的特异性位点突变;分支2中的毒株HA基因存在V394I和NA基因存在V71A、K343E、A395V和V401I的特异性位点突变.同时,分支1中的毒株HA基因与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比存在179-181KND的特异性缺失突变,与B/Colorado/06/2017相比存在181D的特异性缺失突变和150环的抗原位点突变.结论 贵州省BV系暴发疫情毒株之间存在一定的差距,但暴发疫情毒株与普通流行毒株之间亲缘关系和同源性较高,2019年存在两个分支群系毒株的流行,且暴发疫情、重症病例毒株主要以分支1中的毒株流行为主;贵州省暴发疫情、重症病例毒株存在多个位点的特异性突变和缺失突变,应进一步加强分子特征的实时监测和致病力相关的特异性分子靶标研究.
文献关键词:
BV系流感;暴发疫情;HA和NA基因;分子特征
中图分类号:
作者姓名:
万永虎;任丽娟;郑勤妮;庄丽;蒋维佳;雷明玉;李世军;牟鸿江;郭华
作者机构:
贵州省疾病预防控制中心,贵阳 550004
文献出处:
引用格式:
[1]万永虎;任丽娟;郑勤妮;庄丽;蒋维佳;雷明玉;李世军;牟鸿江;郭华-.2017-2019年贵州省BV系流感病毒的分子特征分析)[J].中国人兽共患病学报,2022(04):366-373
A类:
S14N,G144D,V195I,K513R,Q371K,D490N,G148R,K151E,T563A,V394I,V71A,K343E,A395V,V401I,181KND,181D
B类:
BV,流感病毒,分子特征,暴发疫情,分子靶标,通流,流行毒株,HA,NA,有毒,基因进化树,拓扑结构,集为,一簇,较远,绝大部分,疫苗株,Colorado,同源性,当年度,A395T,特异性位点,位点突变,Brisbane,缺失突变,抗原位点,亲缘关系,群系,个位,致病力
AB值:
0.164748
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